16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_6007 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5427  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  215  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.642999 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6007  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  215  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000388026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0168  hypothetical protein  51.43 
 
 
693 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4231  phage integrase  35.71 
 
 
717 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295856  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  48.61 
 
 
741 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4986  phage integrase family protein  46.48 
 
 
724 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0530  phage integrase family protein  46.48 
 
 
724 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553889  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3035  phage integrase family protein  46.48 
 
 
724 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661955  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4142  hypothetical protein  42.42 
 
 
713 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.285848  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3162  hypothetical protein  40.26 
 
 
714 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541887  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0803  hypothetical protein  50 
 
 
721 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.148345  normal  0.675671 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4886  phage integrase family protein  43.75 
 
 
707 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.717526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2616  integrase family protein  33.33 
 
 
572 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2815  phage integrase family protein  34.95 
 
 
709 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.952182  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  57.14 
 
 
645 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2253  hypothetical protein  41.27 
 
 
714 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>