More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3888 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  69.23 
 
 		 225 aa  308  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  68.78 
 
 		 223 aa  306  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  61.64 
 
 		 233 aa  286  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  63.01 
 
 		 252 aa  285  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  61.64 
 
 		 224 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  63.35 
 
 		 255 aa  282  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1842  two component transcriptional regulator  61.64 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  62.44 
 
 		 235 aa  281  7.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  62.44 
 
 		 235 aa  281  7.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  61.64 
 
 		 241 aa  280  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 		 226 aa  278  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.19 
 
 		 241 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  62.1 
 
 		 234 aa  277  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  60.73 
 
 		 241 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  61.19 
 
 		 230 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  61.82 
 
 		 228 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.36 
 
 		 248 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0406  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.06 
 
 		 232 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.076876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  62.61 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.82 
 
 		 228 aa  275  3e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  62.1 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.36 
 
 		 248 aa  274  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0329  response regulator receiver  61.26 
 
 		 232 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  60.73 
 
 		 238 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.27 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0376  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.81 
 
 		 232 aa  271  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  61.36 
 
 		 227 aa  270  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  60.81 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  58.82 
 
 		 228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  59.19 
 
 		 249 aa  264  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.92 
 
 		 226 aa  260  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  53.39 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.4 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 225 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 226 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 226 aa  245  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0016  two component transcriptional regulator  54.5 
 
 		 262 aa  242  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  54.71 
 
 		 230 aa  238  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3447  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 		 277 aa  235  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679069  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9846  two component response regulator  51.13 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.04 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.13 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  49.32 
 
 		 227 aa  231  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4428  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  226  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0281  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000001543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3740  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0282  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.919503  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.73 
 
 		 258 aa  224  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3971  hypothetical protein  52.7 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4110  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3241  two-component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.582303  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3977  two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 224 aa  222  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2085  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6011  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2066  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0109  response regulator receiver  48.65 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000662688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.9 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.767242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0850  two component response regulator  51.36 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 224 aa  217  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2102  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1972  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0274  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3426  DNA-binding transcriptional activator CusR  46.4 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.85 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3534  response regulator receiver protein  47.96 
 
 		 225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3297  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  48.86 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.441835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3127  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.86 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.674952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5679  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.636814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3743  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4625  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 248 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1241  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2907  winged helix family two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00514074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2784  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2876  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 226 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.5251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0258  DNA-binding transcriptional activator CusR  45.05 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4296  DNA-binding transcriptional activator CusR  45.05 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000252174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2409  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.615174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1749  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.1 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0224  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  49.78 
 
 		 225 aa  204  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3519  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.683413  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>