131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0336 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0336  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 
66 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1143  phage transcriptional regulator, AlpA  73.44 
 
 
68 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21173  hitchhiker  1.68687e-05 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3216  phage transcriptional regulator, AlpA  71.88 
 
 
68 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4521  phage transcriptional regulator, AlpA  69.7 
 
 
71 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.243833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0150  phage transcriptional regulator, AlpA  69.35 
 
 
71 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6373  phage transcriptional regulator, AlpA  69.35 
 
 
71 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0267057  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0993  phage transcriptional regulator, AlpA  67.74 
 
 
68 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000350598  decreased coverage  4.94305e-06 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2277  prophage CP4-57 regulatory  70.97 
 
 
71 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0443  phage transcriptional regulator, AlpA  69.35 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  72.41 
 
 
72 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1542  phage transcriptional regulator, AlpA  68.18 
 
 
76 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2652  phage transcriptional regulator, AlpA  66.13 
 
 
71 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0273  phage transcriptional regulator, AlpA  66.13 
 
 
71 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334205  normal  0.0643219 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0102  phage transcriptional regulator, AlpA  64.52 
 
 
71 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  54.55 
 
 
80 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  47.54 
 
 
80 aa  64.7  4e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  49.06 
 
 
70 aa  63.5  9e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  42.62 
 
 
61 aa  63.2  1e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  44.26 
 
 
71 aa  61.2  4e-09  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4520  phage transcriptional regulator, AlpA  43.64 
 
 
88 aa  59.7  1e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  46.43 
 
 
78 aa  59.7  1e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  42.86 
 
 
77 aa  58.9  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  44.83 
 
 
80 aa  59.3  2e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2255  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 
88 aa  58.5  3e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.379253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 
65 aa  57.8  4e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4519  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 
90 aa  57.4  7e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  41.82 
 
 
71 aa  56.2  1e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 
79 aa  56.2  1e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 
67 aa  56.6  1e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1406  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 
76 aa  55.5  2e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  38.98 
 
 
60 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1062  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 
75 aa  55.8  2e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.979085  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  48.15 
 
 
75 aa  55.5  3e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  46 
 
 
66 aa  55.1  3e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.63179e-06 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  39.22 
 
 
68 aa  54.7  4e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  50 
 
 
62 aa  55.1  4e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 
80 aa  55.1  4e-07  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 
66 aa  54.7  4e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 
67 aa  53.9  7e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 
61 aa  53.5  9e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  45 
 
 
81 aa  53.5  1e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  42 
 
 
66 aa  53.1  1e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 
73 aa  53.1  1e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  38.98 
 
 
88 aa  53.1  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  1.57452e-06 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  39.66 
 
 
81 aa  53.1  1e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3106  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 
88 aa  52  2e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.19989 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 
64 aa  51.6  3e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4842  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 
86 aa  52  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.257562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  42.59 
 
 
56 aa  51.6  3e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  40 
 
 
88 aa  51.6  4e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0316  phage DNA binding protein  39.62 
 
 
86 aa  51.2  4e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  48 
 
 
69 aa  50.8  5e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  41.51 
 
 
86 aa  50.4  8e-06  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  37.29 
 
 
65 aa  50.1  9e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  5.80996e-06 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  32.79 
 
 
78 aa  50.1  1e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  41.18 
 
 
64 aa  50.1  1e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1765  phage transcriptional regulator, AlpA  41.07 
 
 
70 aa  48.9  2e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.993884  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0243  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 
74 aa  49.3  2e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.95474  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 
73 aa  48.9  2e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2950  hypothetical protein  32.76 
 
 
103 aa  49.3  2e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.058037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 
70 aa  48.9  2e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 
88 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  38.46 
 
 
88 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 
88 aa  48.9  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 
70 aa  48.9  2e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3275  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 
86 aa  48.5  3e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1859  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 
143 aa  48.5  3e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44263  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3698  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  45.45 
 
 
70 aa  48.9  3e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  43.14 
 
 
75 aa  48.5  3e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2822  transcriptional regulator  39.06 
 
 
98 aa  48.1  4e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.15617  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02082  phage transcriptional regulator, AlpA  38 
 
 
70 aa  48.1  4e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.376453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  35.85 
 
 
95 aa  47.8  5e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 
67 aa  47.8  5e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  37.93 
 
 
67 aa  47.8  5e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 
72 aa  47.4  6e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2186  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  38.18 
 
 
85 aa  47  8e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0232094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 
67 aa  47  9e-05  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 
68 aa  47  9e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0882  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4349  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000832793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  30.91 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1696  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 
68 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0932  phage transcriptional regulator, AlpA  44 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.412381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1597  phage transcriptional regulator, AlpA  34.55 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  36.54 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  38.46 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1051  phage transcriptional regulator, AlpA  32.76 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698345  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2033  phage transcriptional regulator, AlpA  39.58 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.917064  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  35.29 
 
 
72 aa  42.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0242  phage transcriptional regulator, AlpA  43.9 
 
 
70 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.88011  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1598  phage transcriptional regulator, AlpA  33.87 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0771353  normal  0.422154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0567  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001834  predicted transcriptional regulator  29.09 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  32.69 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2193  prophage CP4-57 regulatory  33.96 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>