163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1194 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1194  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  100 
 
 		 369 aa  774    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1951  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  68.22 
 
 		 368 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2492  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.36 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1548  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.45 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1542  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.97 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000135778  unclonable  0.000000000156625 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1441  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.88 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000771176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0006  plasmid maintenance system antidote protein  38.55 
 
 		 380 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0275  DNA-binding protein  37.85 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1016  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03612  Plasmid maintenance system antidote protein  36.42 
 
 		 371 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5647  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.91 
 
 		 362 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1808  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.28 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0483  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.23 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1982  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  71.28 
 
 		 116 aa  150  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.610111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0212  hypothetical protein  31.78 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3170  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  28.85 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.19493  unclonable  0.0000000000000213391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0317  hypothetical protein  25.44 
 
 		 360 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4709  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.86 
 
 		 360 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.29865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0236  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.43 
 
 		 124 aa  122  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20190  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.92 
 
 		 228 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1079  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  27.51 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1543  hypothetical protein  26.65 
 
 		 367 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3332  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  30.19 
 
 		 292 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.5 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3421  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  25.86 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0920  hypothetical protein  29.95 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.409849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2453  helix-turn-helix domain-containing protein  24.55 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.253954  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4195  putative transcription regulator with HTH domain protein  22.49 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0768  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.01 
 
 		 100 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0579  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.5 
 
 		 101 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4510  hypothetical protein  29.32 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2261  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  50.79 
 
 		 76 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000446898  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0750  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  46.48 
 
 		 117 aa  67  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.236771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0019  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.08 
 
 		 98 aa  67  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191318  normal  0.0141037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0386  helix-turn-helix domain-containing protein  29.51 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.375659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0947  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.78 
 
 		 106 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03903  addiction module antidote protein, HigA family  42.17 
 
 		 96 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.433469  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0814  helix-turn-helix domain-containing protein  21.32 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00469966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4027  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.28 
 
 		 101 aa  63.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3070  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.04 
 
 		 151 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2894  addiction module antidote protein, HigA family  46.03 
 
 		 119 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2896  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  44.87 
 
 		 95 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543418 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1093  hypothetical protein  46.38 
 
 		 107 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4756  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.66 
 
 		 100 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0921  hypothetical protein  40.51 
 
 		 151 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1672  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.89 
 
 		 108 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1425  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.79 
 
 		 99 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1105  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.24 
 
 		 105 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2031  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40.79 
 
 		 106 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.65469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2972  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.24 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2564  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.36 
 
 		 116 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.63579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3068  plasmid maintenance system antidote protein  35.53 
 
 		 95 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0091  putative plasmid maintenance system antidote protein  20.1 
 
 		 408 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1754  virulence-associated protein, putative  36.25 
 
 		 104 aa  57  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0614542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0571  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 107 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1543  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.8 
 
 		 118 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01435  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.5 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723657  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2927  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.83 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01447  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753022  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0417  XRE family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3001  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.06 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.770477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2829  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.04 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0896969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1062  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.62 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000765045 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2170  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  37.5 
 
 		 94 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.266724  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2447  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  33.71 
 
 		 128 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.56382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3198  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.52 
 
 		 104 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.562378  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1740  addiction module antidote protein, HigA family  37.5 
 
 		 94 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.368154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1562  addiction module antidote protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1659  addiction module antidote protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2180  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1697  addiction module antidote protein  37.5 
 
 		 94 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1256  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  42.37 
 
 		 103 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0149882 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0403  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.56 
 
 		 99 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1142  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.56 
 
 		 99 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1669  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.62 
 
 		 101 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0533  virulence-associated protein I  35.8 
 
 		 103 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.888429  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1669  addiction module antidote protein  35.8 
 
 		 101 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2089  addiction module antidote protein, HigA family  36.76 
 
 		 94 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0224  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  35.44 
 
 		 99 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.657872  normal  0.19652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4370  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.43 
 
 		 106 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0372671  normal  0.0360192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1216  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.67 
 
 		 101 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3225  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.25 
 
 		 106 aa  53.5  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.114466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0431  hypothetical protein  34.18 
 
 		 108 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1211  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  40 
 
 		 103 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1291  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 98 aa  53.1  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3187  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.15 
 
 		 94 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0487579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0608  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  39.02 
 
 		 98 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0372  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.71 
 
 		 96 aa  53.1  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2430  plasmid maintenance system antidote protein  37.8 
 
 		 108 aa  53.1  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216096  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0642  hypothetical protein  35.63 
 
 		 96 aa  52.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000446232  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1377  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  38.81 
 
 		 99 aa  52.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1065  plasmid maintenance system antidote protein  38.3 
 
 		 101 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1677  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.99 
 
 		 93 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2693  plasmid maintenance system antidote protein, XRE family  36.59 
 
 		 92 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0043  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  35.9 
 
 		 99 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3765  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  32.88 
 
 		 97 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0412  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 100 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4918  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  34.44 
 
 		 99 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0276  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.27 
 
 		 102 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.545625  normal  0.0676813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2649  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.27 
 
 		 102 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.634453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>