More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6404 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
254 aa  512  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  63.49 
 
 
263 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  63.49 
 
 
263 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  63.1 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.98 
 
 
251 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  64.05 
 
 
244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  61.22 
 
 
262 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  64.2 
 
 
248 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.74 
 
 
268 aa  288  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  59.43 
 
 
253 aa  285  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.51 
 
 
244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  61.57 
 
 
236 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.37 
 
 
243 aa  271  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  57.74 
 
 
238 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.66 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  59 
 
 
243 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.16 
 
 
252 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  52.72 
 
 
1088 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  51.82 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.51 
 
 
262 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  48.56 
 
 
1314 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.09 
 
 
1051 aa  235  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.66 
 
 
1053 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.02 
 
 
246 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.81 
 
 
250 aa  221  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.76 
 
 
1053 aa  221  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  43.03 
 
 
1055 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.93 
 
 
1052 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.28 
 
 
525 aa  218  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.08 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.17 
 
 
1051 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.79 
 
 
246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50 
 
 
252 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.98 
 
 
240 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.05 
 
 
248 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.22 
 
 
257 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.8 
 
 
313 aa  202  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.92 
 
 
1050 aa  201  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.22 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.7 
 
 
1053 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.22 
 
 
250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  41.53 
 
 
1125 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  38.05 
 
 
1327 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.84 
 
 
223 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  34.62 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.47 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  33.76 
 
 
218 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.49 
 
 
242 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.17 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  31.3 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.39 
 
 
219 aa  95.5  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  29.74 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.02 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.92 
 
 
220 aa  87  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  32.54 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  32.67 
 
 
986 aa  86.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  29.18 
 
 
207 aa  85.9  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.05 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  31.33 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.9 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  31.76 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  28.46 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  26.38 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  28.12 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
236 aa  82  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.1 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  31.8 
 
 
978 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  30.05 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  29.96 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  31.71 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  30.84 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.93 
 
 
456 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.92 
 
 
456 aa  78.6  0.00000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.96 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.33 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  29.83 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  25.32 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.25 
 
 
233 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  29.76 
 
 
585 aa  76.3  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  27.27 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  31.25 
 
 
965 aa  75.9  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  28.33 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  27.57 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  29.53 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  29.35 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  28.63 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  26.99 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  28.33 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  25 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  28.22 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  27.47 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.85 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  41.01 
 
 
1225 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.03 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  23.5 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.33 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  27.01 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.672792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>