More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4743 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  100 
 
 
457 aa  862    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  41.33 
 
 
1667 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  46.47 
 
 
354 aa  236  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  48.81 
 
 
354 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  41.1 
 
 
335 aa  223  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  46.08 
 
 
354 aa  222  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  43.79 
 
 
1094 aa  216  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  45.42 
 
 
353 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  43.52 
 
 
819 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.81 
 
 
752 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  46.1 
 
 
556 aa  206  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.39 
 
 
451 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  46.64 
 
 
580 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.64 
 
 
689 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  41.33 
 
 
810 aa  192  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.65 
 
 
415 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  42.07 
 
 
479 aa  183  6e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  43.08 
 
 
391 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  40.65 
 
 
387 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  46.92 
 
 
272 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  41.84 
 
 
971 aa  176  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.92 
 
 
366 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.22 
 
 
366 aa  170  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  36.36 
 
 
332 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 
776 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.29 
 
 
607 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 
317 aa  160  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  35.54 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.56 
 
 
320 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.25 
 
 
312 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1882  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.22 
 
 
383 aa  151  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.59 
 
 
348 aa  150  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.53 
 
 
348 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  38.77 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.07 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  40.55 
 
 
1189 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.39 
 
 
313 aa  146  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.55 
 
 
347 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.58 
 
 
348 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.15 
 
 
1170 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.36 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  42.31 
 
 
306 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.51 
 
 
417 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.51 
 
 
406 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32 
 
 
324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.07 
 
 
345 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.89 
 
 
335 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.98 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.64 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.1 
 
 
311 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.88 
 
 
329 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.88 
 
 
329 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.2 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.2 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.2 
 
 
340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1967  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.28 
 
 
370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235271  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.19 
 
 
324 aa  130  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.55 
 
 
310 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.59 
 
 
329 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.77 
 
 
377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.92 
 
 
943 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.25 
 
 
362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.76 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.86 
 
 
366 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.27 
 
 
362 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.36 
 
 
314 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.07 
 
 
328 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.89 
 
 
1056 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0721  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.27 
 
 
344 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.88 
 
 
311 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.8 
 
 
318 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.18 
 
 
332 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.95 
 
 
517 aa  124  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  48.95 
 
 
154 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.93 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.67 
 
 
479 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.8 
 
 
1067 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.75 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.75 
 
 
362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.75 
 
 
362 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.46 
 
 
328 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.98 
 
 
323 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1241  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.73 
 
 
320 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0330167  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.68 
 
 
338 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.83 
 
 
326 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.13 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 
327 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.87 
 
 
601 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.33 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.67 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2583  hypothetical protein  29.39 
 
 
312 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  31.02 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.69 
 
 
336 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.59 
 
 
328 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.3 
 
 
336 aa  117  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  33.88 
 
 
250 aa  117  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.17 
 
 
316 aa  117  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.73 
 
 
320 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1859  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.12 
 
 
329 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.981734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.23 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>