More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2364 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  100 
 
 
492 aa  1018    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  39.53 
 
 
470 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  39.22 
 
 
478 aa  323  4e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  37.97 
 
 
482 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  37.7 
 
 
510 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  36.01 
 
 
490 aa  276  7e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  36.09 
 
 
517 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  32.74 
 
 
631 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  33.06 
 
 
484 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  32.06 
 
 
489 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  33.4 
 
 
553 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  32.53 
 
 
471 aa  220  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  32.91 
 
 
500 aa  219  7e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  33.2 
 
 
548 aa  217  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  34.38 
 
 
513 aa  216  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  30.88 
 
 
472 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  30.67 
 
 
462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  32.35 
 
 
487 aa  212  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  31.52 
 
 
554 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  31.13 
 
 
440 aa  211  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  30.48 
 
 
539 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  32.59 
 
 
517 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  30.43 
 
 
562 aa  207  3e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  31.88 
 
 
497 aa  206  6e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  32.94 
 
 
522 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.31 
 
 
457 aa  205  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  32.43 
 
 
474 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  31.96 
 
 
479 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  31.53 
 
 
551 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  30.14 
 
 
495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  29.19 
 
 
637 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  33.04 
 
 
453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  30.04 
 
 
452 aa  196  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3801  sulfatase  31.16 
 
 
453 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499822  normal  0.102523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  29.42 
 
 
497 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  29.22 
 
 
497 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  29.9 
 
 
497 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  30.9 
 
 
462 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  29.77 
 
 
470 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  29.9 
 
 
497 aa  193  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  32.14 
 
 
460 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  31.55 
 
 
543 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  29.55 
 
 
465 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  30.3 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  29.06 
 
 
480 aa  189  9e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  28.77 
 
 
559 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  28.75 
 
 
491 aa  188  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  32.16 
 
 
481 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  31.45 
 
 
491 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  30.02 
 
 
497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  30.42 
 
 
724 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  29.54 
 
 
501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.99 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  29.9 
 
 
486 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  29.68 
 
 
553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  29.38 
 
 
500 aa  183  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  28.57 
 
 
533 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  28.45 
 
 
581 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  26.92 
 
 
563 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  29.25 
 
 
483 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  31.71 
 
 
468 aa  180  5.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  30.49 
 
 
458 aa  179  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  29.14 
 
 
497 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  30.39 
 
 
551 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  26.99 
 
 
467 aa  174  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  28.63 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  27.96 
 
 
507 aa  173  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00971  iduronate-sulfatase and sulfatase 1 precursor  28.25 
 
 
558 aa  172  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  30.1 
 
 
542 aa  171  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  29.13 
 
 
506 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  27.51 
 
 
523 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  29.24 
 
 
457 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  27.2 
 
 
571 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  26.85 
 
 
520 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  27.82 
 
 
536 aa  169  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4466  sulfatase  28.18 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0640965 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3366  sulfatase  27.29 
 
 
535 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.897843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0931  sulfatase  27.29 
 
 
535 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  28.68 
 
 
542 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  30.45 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0984  sulfatase  27.29 
 
 
535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  29.85 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  29.13 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0296  sulfatase  28.1 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  31.1 
 
 
481 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0819  sulfatase  26.22 
 
 
523 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  28.55 
 
 
543 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  30.26 
 
 
457 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  29.65 
 
 
459 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  27.68 
 
 
506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  27.79 
 
 
766 aa  157  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4261  sulfatase  27.2 
 
 
506 aa  157  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.362858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  29.73 
 
 
559 aa  156  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  27.04 
 
 
584 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  27.46 
 
 
582 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  27.4 
 
 
488 aa  153  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  28.85 
 
 
578 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  28.07 
 
 
462 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  27.29 
 
 
638 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28 
 
 
482 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>