More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1522 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  57.18 
 
 
785 aa  793    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  57.58 
 
 
737 aa  759    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  55.57 
 
 
747 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  63.37 
 
 
741 aa  870    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  100 
 
 
714 aa  1431    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  62.5 
 
 
758 aa  857    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  55.78 
 
 
748 aa  744    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1638  CheA signal transduction histidine kinase  62.18 
 
 
733 aa  844    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  63.08 
 
 
747 aa  870    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  63.96 
 
 
741 aa  875    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  62.43 
 
 
733 aa  838    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  57.09 
 
 
754 aa  763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  50.55 
 
 
715 aa  656    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  63.3 
 
 
746 aa  847    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  62.93 
 
 
751 aa  882    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  56.76 
 
 
739 aa  761    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  61.22 
 
 
744 aa  843    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  61.76 
 
 
747 aa  871    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  54.84 
 
 
745 aa  753    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  61.58 
 
 
744 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  55.9 
 
 
767 aa  774    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  63.04 
 
 
738 aa  860    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  50.96 
 
 
719 aa  673    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  62.28 
 
 
734 aa  840    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  56.32 
 
 
743 aa  780    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  62.12 
 
 
746 aa  856    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  63.66 
 
 
754 aa  867    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  63.33 
 
 
760 aa  873    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  56.21 
 
 
691 aa  706    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  61.29 
 
 
762 aa  862    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  53.1 
 
 
734 aa  707    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  63.12 
 
 
736 aa  848    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  49.14 
 
 
739 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  55.06 
 
 
753 aa  740    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  61.66 
 
 
762 aa  861    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  63.7 
 
 
723 aa  861    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  61.04 
 
 
759 aa  848    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  58.21 
 
 
709 aa  752    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  56.08 
 
 
747 aa  757    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  58.03 
 
 
748 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 
650 aa  593  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  38.04 
 
 
639 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
770 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
687 aa  437  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  36.93 
 
 
769 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.8 
 
 
785 aa  429  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  36.4 
 
 
769 aa  425  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  36.35 
 
 
769 aa  425  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  55.88 
 
 
552 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  55.88 
 
 
552 aa  415  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
652 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
691 aa  386  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  44.14 
 
 
770 aa  387  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  46.93 
 
 
783 aa  385  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  47.22 
 
 
803 aa  380  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
694 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
697 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  45.35 
 
 
770 aa  369  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.38 
 
 
677 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  44.57 
 
 
774 aa  365  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
713 aa  364  3e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 
603 aa  360  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  45.27 
 
 
685 aa  359  8e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  45.73 
 
 
604 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  32.36 
 
 
801 aa  357  5e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
666 aa  356  8.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2218  CheA signal transduction histidine kinases  34.5 
 
 
704 aa  356  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  44 
 
 
681 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 
696 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  32.22 
 
 
720 aa  353  5e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  33.88 
 
 
715 aa  349  9e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  45.88 
 
 
610 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.89 
 
 
927 aa  347  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
598 aa  346  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
606 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2121  chemotaxis protein CheA  33.97 
 
 
702 aa  344  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
607 aa  343  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1282  CheA signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 
697 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000564887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2098  CheA signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
724 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.214324  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
701 aa  342  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.4 
 
 
681 aa  340  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1936  CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 
783 aa  340  8e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.163875  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3221  CheA signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 
635 aa  339  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  43.6 
 
 
601 aa  339  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1594  CheA signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
696 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 
675 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2364  CheA signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
724 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219649  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
701 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2247  CheA signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
728 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.390749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3495  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
695 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0786  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  32.91 
 
 
705 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.380059  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0630  CheA signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
702 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0943  CheA signal transduction histidine kinases  30.54 
 
 
660 aa  335  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0467  CheA signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
724 aa  334  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31682 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  44.24 
 
 
673 aa  334  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
655 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
686 aa  333  8e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3299  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
671 aa  333  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1728  CheA signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
919 aa  332  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
671 aa  332  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>