More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1757 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1757  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 415 aa  838    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  44.68 
 
 		 450 aa  347  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  42.62 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  44.47 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  42.99 
 
 		 444 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  43.33 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  43.33 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1190  recombination factor protein RarA  42.89 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0120628  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  44.26 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  44.13 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  43.61 
 
 		 438 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  40.86 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  41.63 
 
 		 428 aa  338  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  41.09 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  42.48 
 
 		 432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0950  recombination factor protein RarA  44.01 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  41.4 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  45.23 
 
 		 430 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  41.13 
 
 		 447 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  40.89 
 
 		 428 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  41.12 
 
 		 428 aa  333  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  40.89 
 
 		 428 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  40.89 
 
 		 428 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  40.89 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  40.89 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  40.89 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  42.72 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  38.46 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0082  recombination factor protein RarA  40.43 
 
 		 419 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1935  recombination factor protein RarA  41.79 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0363606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1978  recombination factor protein RarA  40.73 
 
 		 422 aa  322  9.000000000000001e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  39.48 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  38.22 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  42.86 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  40.56 
 
 		 434 aa  318  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1846  recombination factor protein RarA  42.47 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  40.29 
 
 		 731 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  39.76 
 
 		 441 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  41.97 
 
 		 435 aa  315  8e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  38.89 
 
 		 437 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  40.19 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  39.43 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  40.33 
 
 		 457 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  38.73 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  37.5 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  39.57 
 
 		 460 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  38.94 
 
 		 436 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1228  recombination factor protein RarA  40.75 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  39.62 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  40.05 
 
 		 434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  37.8 
 
 		 494 aa  309  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  41.71 
 
 		 440 aa  309  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  40.1 
 
 		 434 aa  308  9e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  38.1 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  40.1 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  37.59 
 
 		 445 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  38.72 
 
 		 445 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  37.59 
 
 		 445 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  39.42 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  37.59 
 
 		 445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  38.06 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  39 
 
 		 441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  39.42 
 
 		 739 aa  306  6e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  41.84 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  37.95 
 
 		 456 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  39.04 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  38.04 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  37.62 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  37.96 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  36.58 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  39.32 
 
 		 462 aa  302  7.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  37.59 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0257  recombination factor protein RarA  37.65 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000097809  normal  0.0366003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  38.28 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  36.18 
 
 		 519 aa  300  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  36.49 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  38.68 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1125  AAA ATPase central domain protein  41.45 
 
 		 408 aa  299  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00180693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  37.53 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  37.15 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  38.96 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  37.59 
 
 		 465 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  37.17 
 
 		 436 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  39.32 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  37.98 
 
 		 443 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  38.66 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  38.19 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  37.2 
 
 		 461 aa  295  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  34.88 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  38.52 
 
 		 721 aa  293  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  38.02 
 
 		 474 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  37.07 
 
 		 500 aa  293  5e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0815  AAA ATPase central domain protein  41.75 
 
 		 395 aa  292  7e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  38.75 
 
 		 466 aa  292  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  38.92 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  36.67 
 
 		 456 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0813  recombination factor protein RarA  39.09 
 
 		 446 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0334314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  36.23 
 
 		 490 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  39.9 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  36.43 
 
 		 726 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>