More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0063 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  99.16 
 
 		 358 aa  735    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  100 
 
 		 358 aa  740    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  56.15 
 
 		 357 aa  444  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  48.18 
 
 		 356 aa  363  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  47.9 
 
 		 356 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  47.34 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  44.94 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  44.94 
 
 		 357 aa  329  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  45.81 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  45.33 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  44.92 
 
 		 360 aa  306  3e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  43.79 
 
 		 362 aa  288  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  37.33 
 
 		 370 aa  252  7e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  36.21 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  36.77 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  35.36 
 
 		 370 aa  242  7e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  34.54 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  37.39 
 
 		 383 aa  219  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.63 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  35.81 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.17 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.2 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  33.71 
 
 		 360 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.54 
 
 		 385 aa  195  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.59 
 
 		 382 aa  195  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.59 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  36.07 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  34.9 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  36.53 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  32.96 
 
 		 379 aa  192  8e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.72 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  34.38 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  35.91 
 
 		 381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.81 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  35.34 
 
 		 387 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  34.07 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.98 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  33.06 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  31.88 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  30.58 
 
 		 363 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  32.12 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  32.56 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.08 
 
 		 386 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  33.81 
 
 		 379 aa  176  8e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  30.88 
 
 		 383 aa  175  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  31.51 
 
 		 388 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.2 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.38 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.2 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  31.61 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  31.06 
 
 		 379 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.86 
 
 		 387 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  32.12 
 
 		 385 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  31.67 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  29.89 
 
 		 400 aa  169  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  30.92 
 
 		 396 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.64 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  33.14 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  31.28 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.56 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  30.56 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  29.04 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  31.23 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  31.07 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  31.44 
 
 		 406 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  31.58 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.95 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  32.94 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  30.79 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  30.83 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  31.73 
 
 		 406 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  30.19 
 
 		 406 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  31.14 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  31.58 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  31.18 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  30.28 
 
 		 397 aa  159  8e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  30.53 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  29.92 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  31.41 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  30.43 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  31.56 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  29.92 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.12 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  30.56 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  31.41 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.12 
 
 		 394 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  31.28 
 
 		 376 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  31.23 
 
 		 421 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  30.2 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  32.23 
 
 		 396 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  28 
 
 		 414 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  30.39 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  28.41 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  28.41 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.18 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  31.27 
 
 		 400 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  28.82 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  31.39 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>