76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00720 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND00720  conserved protein  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  32.71 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
211 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.03 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  31.44 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  30.3 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  33.19 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
230 aa  79  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  30.33 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  27.27 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.74 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.09 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.08 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  30 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  28.22 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.23 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1972  NmrA-like  26.7 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.87 
 
 
211 aa  67  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.24 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  27.19 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  26.84 
 
 
219 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  27.22 
 
 
223 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0163  NmrA-like protein  27.15 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
215 aa  62.4  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  27.35 
 
 
218 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  28.26 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  25.58 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  25.58 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  25.98 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4864  hypothetical protein  28.65 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.542639 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3807  hypothetical protein  28.65 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0422433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  26.26 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  26.78 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  26.78 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  26.78 
 
 
216 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  30.22 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  30.22 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  28.51 
 
 
374 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  26.38 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
212 aa  49.3  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  23.56 
 
 
212 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  28.57 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.78 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  28.65 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.91 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  26.8 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.86 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.86 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  25.22 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
211 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0474  saccharopine dehydrogenase related protein  26.18 
 
 
205 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0200895  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47367  predicted protein  24.35 
 
 
366 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.389479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  21.43 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  21.46 
 
 
223 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>