More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1888 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  44.54 
 
 		 786 aa  672    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  45.38 
 
 		 762 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  100 
 
 		 743 aa  1541    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  44.4 
 
 		 765 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  42.29 
 
 		 767 aa  615  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  42.61 
 
 		 785 aa  615  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  43.86 
 
 		 759 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  42.84 
 
 		 768 aa  589  1e-167  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  42.8 
 
 		 772 aa  585  1e-166  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  41.02 
 
 		 850 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  43.19 
 
 		 854 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  41.25 
 
 		 815 aa  559  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  41.03 
 
 		 773 aa  555  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  41.21 
 
 		 740 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  40.59 
 
 		 794 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  38.96 
 
 		 786 aa  512  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  39.75 
 
 		 783 aa  497  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  38.62 
 
 		 862 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 		 870 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 		 857 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 		 857 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.35 
 
 		 774 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 		 857 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  37.69 
 
 		 858 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.89 
 
 		 752 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  39.22 
 
 		 838 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.81 
 
 		 750 aa  464  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  38.55 
 
 		 821 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 		 846 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  39.03 
 
 		 841 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  37.95 
 
 		 888 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.03 
 
 		 846 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  37.96 
 
 		 730 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.97 
 
 		 834 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  37.48 
 
 		 776 aa  461  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  38.44 
 
 		 907 aa  456  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 810 aa  458  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  38.79 
 
 		 839 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  38.79 
 
 		 844 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  38.79 
 
 		 839 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  38.79 
 
 		 928 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  38.79 
 
 		 844 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  37.59 
 
 		 742 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  38.79 
 
 		 844 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  38.6 
 
 		 826 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  38.79 
 
 		 844 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  37.65 
 
 		 850 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  39.49 
 
 		 787 aa  452  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  38.04 
 
 		 787 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 760 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  39.36 
 
 		 801 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 		 743 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 		 743 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 		 743 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 		 846 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.8 
 
 		 762 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  36.67 
 
 		 732 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.38 
 
 		 755 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 		 728 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  37.14 
 
 		 698 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  33.15 
 
 		 795 aa  353  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  33.29 
 
 		 748 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  31.65 
 
 		 829 aa  330  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  30.98 
 
 		 841 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  30.28 
 
 		 818 aa  328  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 		 827 aa  327  6e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  30.21 
 
 		 796 aa  327  7e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  31.19 
 
 		 818 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  32.09 
 
 		 809 aa  319  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  30.23 
 
 		 779 aa  319  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  30.23 
 
 		 794 aa  318  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  30.87 
 
 		 797 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  29.24 
 
 		 839 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  28.98 
 
 		 839 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  30.92 
 
 		 797 aa  315  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  30.18 
 
 		 777 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  30.62 
 
 		 824 aa  314  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  28.99 
 
 		 839 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 862 aa  313  7.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  30.35 
 
 		 799 aa  313  9e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  29.08 
 
 		 839 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  28.99 
 
 		 843 aa  312  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  30.8 
 
 		 833 aa  312  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  31.22 
 
 		 830 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  29.06 
 
 		 844 aa  311  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  28.71 
 
 		 844 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  31.61 
 
 		 819 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  28.71 
 
 		 844 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  28.5 
 
 		 839 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  31.75 
 
 		 850 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  30.42 
 
 		 773 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  31.62 
 
 		 850 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  31.62 
 
 		 850 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  31.62 
 
 		 850 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  28.91 
 
 		 847 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  30.26 
 
 		 778 aa  308  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  29.15 
 
 		 822 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  31.5 
 
 		 850 aa  307  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  30.21 
 
 		 805 aa  307  6e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  30.08 
 
 		 808 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>