More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0689 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0689  ExbBTolQ family transport protein  100 
 
 
192 aa  386  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00337  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1523  ExbBTolQ family transport protein  62.83 
 
 
199 aa  233  2e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  1.17252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0919  ExbBTolQ family transport protein  66.89 
 
 
155 aa  209  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.014762  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.55 
 
 
195 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0144  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  54.29 
 
 
184 aa  183  1e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  2.07566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0116  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  54.29 
 
 
184 aa  183  2e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000187763  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0104  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  53.71 
 
 
184 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1740  transcription elongation factor GreA  64.18 
 
 
135 aa  176  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.97626  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0197  TonB system transport protein ExbB  51.67 
 
 
186 aa  177  1e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  9.67122e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1401  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.83 
 
 
188 aa  146  1e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.471919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.52 
 
 
233 aa  78.2  7e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.81 
 
 
225 aa  77.4  1e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  30.48 
 
 
231 aa  77  1e-13  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  39.34 
 
 
248 aa  76.3  3e-13  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.26 
 
 
232 aa  74.3  9e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  56.06 
 
 
223 aa  73.6  2e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  43.3 
 
 
229 aa  73.6  2e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  37.5 
 
 
241 aa  73.6  2e-12  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0282  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
230 aa  73.2  2e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235807  hitchhiker  0.000672493 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  33.79 
 
 
228 aa  72.8  3e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  40.78 
 
 
237 aa  72.4  4e-12  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  40.78 
 
 
237 aa  72.4  4e-12  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.89 
 
 
230 aa  72  4e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  53.03 
 
 
229 aa  72  5e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.76197e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  38.94 
 
 
232 aa  72  5e-12  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  42 
 
 
233 aa  71.6  6e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  46.34 
 
 
225 aa  71.6  6e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  42 
 
 
233 aa  71.6  6e-12  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  40.66 
 
 
253 aa  71.6  6e-12  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.75 
 
 
244 aa  71.6  6e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.03 
 
 
229 aa  71.6  7e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  31.29 
 
 
235 aa  71.2  7e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 
311 aa  71.2  8e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  45.21 
 
 
231 aa  71.2  8e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.03 
 
 
229 aa  71.2  8e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.39 
 
 
223 aa  71.2  8e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.39 
 
 
223 aa  71.2  8e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.21 
 
 
231 aa  71.2  8e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  42.53 
 
 
225 aa  71.2  9e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.89 
 
 
228 aa  70.5  1e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.32 
 
 
268 aa  70.5  1e-11  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  37.4 
 
 
238 aa  70.9  1e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  36.89 
 
 
228 aa  70.5  1e-11  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.43293e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  41.35 
 
 
238 aa  70.5  1e-11  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  36.89 
 
 
228 aa  70.5  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.45733e-06  hitchhiker  3.09411e-06 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  41.35 
 
 
238 aa  70.5  1e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  36.89 
 
 
228 aa  70.5  1e-11  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.21899e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  41.35 
 
 
238 aa  70.5  1e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
228 aa  69.7  2e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.01898e-05  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  50 
 
 
228 aa  69.7  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
228 aa  69.7  2e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  8.58501e-05  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.84 
 
 
229 aa  70.1  2e-11  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.49 
 
 
227 aa  69.7  2e-11  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
228 aa  69.7  2e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  48.61 
 
 
225 aa  69.7  2e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  48.61 
 
 
224 aa  70.1  2e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.98 
 
 
224 aa  70.1  2e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.20137e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  48.61 
 
 
224 aa  70.1  2e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
235 aa  69.3  3e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  44.83 
 
 
236 aa  69.3  3e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 
230 aa  69.3  3e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  44.83 
 
 
236 aa  69.3  4e-11  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.7 
 
 
230 aa  68.9  4e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.97 
 
 
230 aa  68.9  4e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.61 
 
 
224 aa  68.9  4e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.66729e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.07 
 
 
228 aa  69.3  4e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  9.15639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  50.7 
 
 
227 aa  68.9  4e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.71 
 
 
313 aa  68.9  4e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  44.83 
 
 
236 aa  69.3  4e-11  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.19 
 
 
231 aa  68.9  5e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  41.67 
 
 
232 aa  68.6  5e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  41.57 
 
 
234 aa  68.6  6e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.44 
 
 
232 aa  68.6  6e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 
235 aa  68.2  7e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 
229 aa  68.2  7e-11  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  43.18 
 
 
231 aa  67.8  8e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0118  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.64 
 
 
241 aa  67.8  8e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  43.18 
 
 
231 aa  67.8  8e-11  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  43.18 
 
 
231 aa  67.8  8e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  43.18 
 
 
231 aa  67.8  8e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  43.66 
 
 
232 aa  67.8  9e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  51.35 
 
 
230 aa  67.8  9e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2078  tolQ protein  44.87 
 
 
225 aa  67  1e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.87 
 
 
225 aa  67  1e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.923457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0725  protein TolQ  44.05 
 
 
230 aa  67.4  1e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.750364  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2664  tolQ protein  44.87 
 
 
225 aa  67  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1946  tolQ protein  44.87 
 
 
225 aa  67  1e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39 
 
 
231 aa  67.4  1e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3200  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.87 
 
 
225 aa  67  1e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.949255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0830  tolQ protein  44.87 
 
 
225 aa  67  1e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.56 
 
 
229 aa  67.4  1e-10  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.87618e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  36.7 
 
 
224 aa  67.4  1e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  36.7 
 
 
224 aa  67.4  1e-10  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.53 
 
 
299 aa  67  1e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  40 
 
 
231 aa  67.4  1e-10  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  44.87 
 
 
225 aa  67.4  1e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  40.38 
 
 
238 aa  67.4  1e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  40.38 
 
 
238 aa  67.4  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
225 aa  67  2e-10  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 
229 aa  66.6  2e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>