More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0577 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  100 
 
 		 367 aa  729    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  54.67 
 
 		 368 aa  381  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  53.53 
 
 		 368 aa  381  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  38.57 
 
 		 376 aa  275  9e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  44.94 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  45.1 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  44.81 
 
 		 369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  40.13 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  42.6 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  39.93 
 
 		 406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  46.74 
 
 		 373 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  42.16 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  35.2 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  35.35 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  39.8 
 
 		 370 aa  219  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  35.35 
 
 		 372 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  40.51 
 
 		 373 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  35.71 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  39.84 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  41.32 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  38.13 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  41.18 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  31.64 
 
 		 387 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  40.59 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  34.46 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  33.24 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  30.25 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  32.56 
 
 		 384 aa  206  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  34.71 
 
 		 374 aa  205  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 		 377 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  35.56 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  36.51 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  36.23 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  36.82 
 
 		 413 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  33.63 
 
 		 376 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  40.07 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  39.72 
 
 		 377 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  33.64 
 
 		 384 aa  199  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  40.46 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  37.7 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  39.72 
 
 		 377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  43.3 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  40.73 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  31.18 
 
 		 378 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  30.36 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  29.86 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  32.63 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  29.48 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  30.79 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  30.13 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  33.23 
 
 		 376 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  31.46 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  32.09 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  30.88 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  30.26 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  34.71 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  37.35 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  36.6 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  35.85 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  31.22 
 
 		 383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  28.73 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  29.67 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  31.06 
 
 		 447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  35.01 
 
 		 474 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  31.06 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  38.31 
 
 		 364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  30.47 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  30.72 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  30.47 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  31.06 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  31.06 
 
 		 374 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  39.3 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  33.66 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  27.64 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  27.78 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  30.94 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  37.55 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  29.53 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  30.7 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  27.64 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  31.02 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  36.69 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  31.21 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  35.25 
 
 		 384 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  29.01 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  37.61 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  39.09 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  33.72 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  38.94 
 
 		 376 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  32.21 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  30.43 
 
 		 425 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  30.87 
 
 		 376 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0920  hypothetical protein  31.06 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0250  hypothetical protein  30.54 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0244  protein of unknown function DUF140  30.54 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  40.78 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  38.27 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  29.6 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>