More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0920 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0920  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  738    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  74.4 
 
 
375 aa  558  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  72.63 
 
 
376 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0244  protein of unknown function DUF140  74.66 
 
 
372 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0250  hypothetical protein  74.39 
 
 
372 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  61.42 
 
 
383 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  65.34 
 
 
376 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  62.83 
 
 
382 aa  424  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  62.5 
 
 
388 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  56.08 
 
 
374 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  56.08 
 
 
374 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  54.97 
 
 
374 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  54.08 
 
 
376 aa  359  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  51.92 
 
 
379 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  54.78 
 
 
357 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  50.83 
 
 
374 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  50 
 
 
374 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  50.83 
 
 
447 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  50 
 
 
374 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  50.28 
 
 
374 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0491  protein of unknown function DUF140  50.67 
 
 
377 aa  332  5e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13825  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4225  ABC transporter inner membrane protein  50.94 
 
 
377 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  52.68 
 
 
378 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  49.86 
 
 
374 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  50.82 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3201  putative ABC transporter, permease protein  50.55 
 
 
366 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0232  putative ABC transporter, permease protein  50.55 
 
 
366 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  50.55 
 
 
374 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  50.55 
 
 
374 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  50.55 
 
 
374 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  50.55 
 
 
428 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  50.62 
 
 
368 aa  316  5e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0066  ABC transporter, permease protein  53.27 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  51.83 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  47.78 
 
 
425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  44.02 
 
 
373 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0174  ABC transporter, permease protein, putative  50.15 
 
 
406 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  42.01 
 
 
378 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  42.01 
 
 
378 aa  256  4e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  38.06 
 
 
406 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  39.51 
 
 
364 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  40.43 
 
 
366 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  36.23 
 
 
372 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  37.33 
 
 
413 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  39.58 
 
 
366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  37.46 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  39.27 
 
 
366 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  35.94 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  37.36 
 
 
430 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  37.02 
 
 
378 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  37.87 
 
 
384 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  34.96 
 
 
378 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  35.52 
 
 
383 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  41.1 
 
 
364 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  31.06 
 
 
367 aa  187  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  34.26 
 
 
378 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  34.76 
 
 
369 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  35.58 
 
 
368 aa  187  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  34.76 
 
 
369 aa  187  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  34.89 
 
 
376 aa  186  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  32.96 
 
 
396 aa  187  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  34.81 
 
 
382 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  34.45 
 
 
369 aa  186  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  32.68 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  37.38 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  31.87 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  35.56 
 
 
368 aa  183  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  34.56 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  38.93 
 
 
377 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  33.14 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  32.53 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  32.21 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  36.22 
 
 
381 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  38.91 
 
 
380 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  36.67 
 
 
382 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  42.5 
 
 
365 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  35.84 
 
 
378 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  33.64 
 
 
373 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  34.74 
 
 
383 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  36.57 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  36.14 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  36.11 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  36.16 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  35.38 
 
 
474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  36.34 
 
 
383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  37.27 
 
 
386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  37.42 
 
 
384 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  35.65 
 
 
383 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  40.16 
 
 
377 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  36.49 
 
 
374 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  36.49 
 
 
374 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  39.38 
 
 
377 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 
377 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  32.98 
 
 
382 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  43.1 
 
 
375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  34.23 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  36.17 
 
 
377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  34.22 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  42.52 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>