More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0096 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0096  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 181 aa  361  3e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.428124  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1765  50S ribosomal protein L5  82.32 
 
 		 181 aa  311  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00103364  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0071  50S ribosomal protein L5  82.87 
 
 		 181 aa  310  5.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0205797  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1021  50S ribosomal protein L5  82.32 
 
 		 181 aa  309  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000164451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0046  50S ribosomal protein L5  82.12 
 
 		 180 aa  308  2.9999999999999997e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.772489  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1863  50S ribosomal protein L5  81.77 
 
 		 181 aa  308  4e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1692  50S ribosomal protein L5  81.77 
 
 		 181 aa  308  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0046073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2069  50S ribosomal protein L5  81.22 
 
 		 181 aa  307  5e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1956  ribosomal protein L5  74.03 
 
 		 181 aa  291  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0298  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 181 aa  230  7.000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00106254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 179 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  214  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 186 aa  214  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 186 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  53.14 
 
 		 192 aa  210  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  50.85 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  52.81 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  53.63 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 179 aa  207  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 180 aa  207  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 184 aa  207  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 180 aa  207  8e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 193 aa  207  9e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 		 193 aa  206  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  50.85 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 		 180 aa  206  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 182 aa  206  1e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 186 aa  206  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0331  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.86209e-22  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 180 aa  205  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 193 aa  205  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  50.57 
 
 		 180 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2762  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000046872  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  50.57 
 
 		 180 aa  205  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  52.81 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 182 aa  204  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  52.51 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 184 aa  204  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  49.72 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 180 aa  202  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  50.85 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 180 aa  202  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  201  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 		 180 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  50.85 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 187 aa  201  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  52.25 
 
 		 180 aa  201  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 180 aa  201  5e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  51.7 
 
 		 182 aa  201  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  50.28 
 
 		 179 aa  201  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 182 aa  201  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  50.85 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 183 aa  201  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  49.16 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>