185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1783 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 286 aa  580  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.529991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2132  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  75.36 
 
 		 286 aa  431  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  62.63 
 
 		 283 aa  365  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.10851  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  56.93 
 
 		 282 aa  333  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1928  tRNA synthetase class II (G H P and S)  52.73 
 
 		 284 aa  308  5e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0074  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  47.65 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  34.03 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  31.36 
 
 		 401 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  33.57 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  24.44 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  22.83 
 
 		 409 aa  65.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  23.79 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 418 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  25.89 
 
 		 420 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  26.8 
 
 		 430 aa  62.4  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  25.87 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.24 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  32.28 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  27.7 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  25.25 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  22.33 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  29.53 
 
 		 419 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  25.26 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 419 aa  57  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 470 aa  55.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2787  histidine--tRNA ligase  29.75 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.14 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  24.91 
 
 		 412 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 		 421 aa  55.1  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  24.91 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 423 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 		 410 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1288  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.53 
 
 		 420 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.49 
 
 		 434 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  24.31 
 
 		 421 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1495  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.53 
 
 		 420 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 		 414 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0640  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.91 
 
 		 395 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.32 
 
 		 438 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.47 
 
 		 394 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1289  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.53 
 
 		 420 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 435 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1563  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.12 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1524  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.19 
 
 		 420 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1315  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.12 
 
 		 420 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1424  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.12 
 
 		 420 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.67 
 
 		 389 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.89 
 
 		 440 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3533  histidyl-tRNA synthetase 2  22.68 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1457  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.32 
 
 		 420 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1489  Histidine--tRNA ligase  25.4 
 
 		 383 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00266166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  26.47 
 
 		 438 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 445 aa  52.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.3 
 
 		 401 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  23.86 
 
 		 430 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 408 aa  52.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  20.77 
 
 		 377 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  27.16 
 
 		 423 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 423 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.86 
 
 		 370 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.45 
 
 		 440 aa  52.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf392  histidyl-tRNA synthetase  23.32 
 
 		 417 aa  52.4  0.000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.438879  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.67 
 
 		 420 aa  52.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 		 408 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  24.48 
 
 		 429 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0615  tRNA synthetase, class II (G, H, P and S)  22.85 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.542186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 		 411 aa  50.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl366  histidyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113949  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3887  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.73 
 
 		 420 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 414 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5668  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.12 
 
 		 394 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863885  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 		 430 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07590  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.28 
 
 		 395 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  27.86 
 
 		 414 aa  50.4  0.00003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1555  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  24.73 
 
 		 535 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 		 420 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  25.34 
 
 		 420 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>