More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0784 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0784  transcription antitermination protein NusB  100 
 
 		 131 aa  263  5.999999999999999e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1180  transcription antitermination protein NusB  69.47 
 
 		 131 aa  186  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1333  transcription antitermination protein NusB  56.25 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0431  transcription antitermination protein NusB  54.33 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.232136  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0405  transcription antitermination protein NusB  54.33 
 
 		 132 aa  140  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1576  transcription antitermination protein NusB  53.54 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0403  transcription antitermination protein NusB  54.2 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0030  transcription antitermination protein NusB  52.76 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0541  transcription antitermination protein NusB  57.25 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1747  transcription antitermination factor NusB  52.34 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1148  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000166968  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3465  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0058  NusB antitermination factor  37.98 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1100  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000596608  normal  0.728168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1166  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00313304  normal  0.241653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1100  transcription antitermination protein NusB  38.89 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000020777  normal  0.579105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3299  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000241409  decreased coverage  0.0000953408 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3156  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3154  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000167856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1215  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000478736  normal  0.242008 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1191  transcription antitermination protein NusB  37.3 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000719059  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2774  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000145309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1386  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000224744  unclonable  0.0000000173343 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0831  transcription antitermination protein NusB  35.56 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000197838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1039  transcription antitermination protein NusB  37.3 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000044365  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1020  transcription antitermination protein NusB  38.1 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0603  transcription antitermination protein NusB  36.72 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.016248  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1277  transcription antitermination protein NusB  35.94 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000199863  unclonable  0.0000000000534165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2589  NusB antitermination factor  34.07 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0030  NusB antitermination factor  30.6 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1328  NusB antitermination factor  30.23 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.732904  normal  0.808756 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1424  NusB antitermination factor  33.08 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.132746  normal  0.0757739 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0096  transcription antitermination protein NusB  34.62 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06300  NusB antitermination factor  32.81 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000202636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1295  NusB antitermination factor  31.54 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2652  transcription antitermination protein NusB  30.08 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2875  transcription antitermination protein NusB  35.11 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0967797  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3601  transcription antitermination factor NusB  29.2 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0459  NusB antitermination factor  32.35 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.730016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12553  transcription antitermination protein NusB  28.03 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0342122 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0301  transcription antitermination factor NusB  37.04 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0477  NusB antitermination factor  37.04 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.144816  hitchhiker  0.000124521 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1628  NusB antitermination factor  31.34 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000476321  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00364  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.997296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3193  NusB antitermination factor  37.5 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0337  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.570636  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1085  transcription antitermination protein NusB  44.93 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.770091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0487  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0498  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0447  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00368  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3217  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0452  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2897  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1074  transcription antitermination protein NusB  35.54 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547473  hitchhiker  0.000302454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1692  N utilization substance protein B  32.12 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1616  transcription antitermination protein NusB  45.71 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4292  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3283  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0942  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1027  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1279  NusB antitermination factor  29.01 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0274165  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5248  NusB antitermination factor  37.93 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1583  transcription antitermination protein NusB  45.71 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00456723  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0459  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0520  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4255  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1532  transcription termination/antitermination factor NusB  34.38 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4086  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0398427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3924  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3935  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242683  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0465  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12640  transcription antitermination factor NusB  31.34 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0196868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4406  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2075  NusB antitermination factor  30.15 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4312  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4202  transcription antitermination protein NusB  42.31 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000627912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2179  NusB antitermination factor  31.16 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219887  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0478  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1166  transcription antitermination protein NusB  34.13 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000379162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0457  transcription antitermination protein NusB  36.67 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.478814  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15520  transcription antitermination factor NusB  37.84 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2438  transcription antitermination factor NusB  30.08 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.841246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1752  NusB antitermination factor  33.06 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1865  NusB antitermination factor  36.07 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.2665  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0847  transcription antitermination protein NusB  33.09 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04396  transcription antitermination protein NusB  46.05 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3481  NusB antitermination factor  28.68 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0412156  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3088  transcription antitermination protein NusB  37.5 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4458  transcription antitermination protein NusB  36.03 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3165  transcription antitermination protein NusB  34.71 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1396  NusB antitermination factor  31.25 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1521  NusB antitermination factor  27.69 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000719098  normal  0.286205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3115  transcription antitermination protein NusB  34.71 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2078  transcription antitermination protein NusB  33.33 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00119189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1792  transcription antitermination protein NusB  34.38 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4282  NusB antitermination factor  26.12 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.683816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3256  transcription antitermination protein NusB  34.71 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2334  transcription antitermination factor NusB  33.83 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0502  NusB antitermination factor  32.84 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>