More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0069 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  100 
 
 
409 aa  850    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  99.51 
 
 
408 aa  843    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  56.08 
 
 
399 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  55.56 
 
 
399 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.23 
 
 
403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 
406 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  43.32 
 
 
405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  40.51 
 
 
405 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 
400 aa  252  8.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  36.11 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  34.49 
 
 
427 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  33.92 
 
 
404 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  36.05 
 
 
408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  33.92 
 
 
402 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  34.01 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  35.73 
 
 
404 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  33.95 
 
 
427 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  34.15 
 
 
399 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
396 aa  209  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 
399 aa  209  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  34.13 
 
 
400 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 
400 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
403 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  36.13 
 
 
400 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  33.51 
 
 
390 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  34.26 
 
 
625 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 
394 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  31.51 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  33 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  34.7 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  31.16 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  31.73 
 
 
396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  31.63 
 
 
398 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  32.56 
 
 
396 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 
399 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  32.09 
 
 
397 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.64 
 
 
396 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
395 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  32.65 
 
 
398 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  29.75 
 
 
407 aa  189  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  34.7 
 
 
402 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  32.59 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  31.37 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  30.97 
 
 
410 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 
400 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  30.97 
 
 
408 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  31.19 
 
 
409 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  32.63 
 
 
399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 
398 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  30.3 
 
 
410 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  30.3 
 
 
410 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  31.09 
 
 
403 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  31.37 
 
 
422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  31.37 
 
 
422 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  31.1 
 
 
422 aa  173  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  31.1 
 
 
422 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  31.1 
 
 
422 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  31.1 
 
 
422 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  31.1 
 
 
422 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  30.56 
 
 
422 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
422 aa  170  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  27.86 
 
 
416 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  29.62 
 
 
416 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  28.98 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  28.98 
 
 
422 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  28.98 
 
 
422 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  29.06 
 
 
422 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  29.62 
 
 
416 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  28.98 
 
 
422 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  29.13 
 
 
403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  29.08 
 
 
416 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
437 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
367 aa  136  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
362 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  28.09 
 
 
383 aa  133  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.5 
 
 
373 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3093  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2959  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  34.77 
 
 
373 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.77 
 
 
373 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  28.02 
 
 
367 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  34.77 
 
 
373 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.41 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.41 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.41 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.41 
 
 
373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3043  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 
369 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 
371 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2799  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 
380 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  26.7 
 
 
373 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>