More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5790 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  68.48 
 
 		 461 aa  650    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  66.95 
 
 		 468 aa  634    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  68.85 
 
 		 469 aa  666    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  83.61 
 
 		 477 aa  812    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  68.48 
 
 		 461 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 477 aa  955    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  68.7 
 
 		 461 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  82.39 
 
 		 477 aa  782    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  68.48 
 
 		 464 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  71.96 
 
 		 468 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  71.37 
 
 		 467 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  66 
 
 		 459 aa  634  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  67.25 
 
 		 461 aa  628  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  65.32 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  65.32 
 
 		 457 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  65.32 
 
 		 457 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  64.65 
 
 		 457 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  62.39 
 
 		 463 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  64.94 
 
 		 406 aa  535  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  55.04 
 
 		 456 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 493 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 		 453 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  47.98 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 458 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 		 452 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 468 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 442 aa  339  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 439 aa  329  7e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 		 446 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.84 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  36.94 
 
 		 430 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 441 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  37.25 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  37.61 
 
 		 442 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  39.12 
 
 		 482 aa  266  7e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.85 
 
 		 447 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 447 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.47 
 
 		 468 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 450 aa  256  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.35 
 
 		 437 aa  256  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  36.08 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  40.31 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  40.31 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  40.31 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.05 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.05 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.05 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 432 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 432 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  40.1 
 
 		 432 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  37.91 
 
 		 466 aa  249  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.26 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 439 aa  246  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  36.3 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  35.12 
 
 		 470 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  36.47 
 
 		 456 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 439 aa  243  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  37 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  33.33 
 
 		 465 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.47 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  34.59 
 
 		 484 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  40 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  34.09 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  35.51 
 
 		 470 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  36.36 
 
 		 433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 457 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  37.62 
 
 		 482 aa  240  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 445 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  35.62 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  35.62 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  35.39 
 
 		 433 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 460 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  37.28 
 
 		 452 aa  239  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  36.92 
 
 		 430 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.22 
 
 		 437 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  35.41 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  36.68 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  36.62 
 
 		 439 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  36.57 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  34.04 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  36.12 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  34.04 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 628 aa  237  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  34.04 
 
 		 434 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>