42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0087 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  100 
 
 		 125 aa  254  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  71.68 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  69.91 
 
 		 172 aa  161  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  38.32 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  35.4 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  40.18 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  38.18 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  39.81 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  39.18 
 
 		 165 aa  57  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  33.03 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  34.82 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  33.91 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  34.86 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  34.71 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  35.96 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  34.51 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  30.43 
 
 		 165 aa  52  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  37.76 
 
 		 189 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  37.11 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  32.43 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  29.2 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  32.08 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  32.46 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  32.11 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  30.83 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0578  hypothetical protein  30.28 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  33.93 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  32.76 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  33.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  33.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  33.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  32.67 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  33.96 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  31.82 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  27.78 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  29.73 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  29.91 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  33.04 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  35.85 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  29.36 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  30.77 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>