130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6933 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4502  ATPase  53.43 
 
 		 734 aa  779    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466398  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6933  ATPase  100 
 
 		 781 aa  1596    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0939  ATPase  58.25 
 
 		 810 aa  361  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77127  unclonable  0.0000328299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0829  ATPase  56.71 
 
 		 609 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0846  ATPase  56.71 
 
 		 609 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.982991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  60 
 
 		 655 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  44.69 
 
 		 805 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.5 
 
 		 465 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04212  5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrBC, subunit McrB  43.11 
 
 		 459 aa  235  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04176  hypothetical protein  43.11 
 
 		 459 aa  235  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1214  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.12 
 
 		 732 aa  226  9e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.581782 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1282  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.91 
 
 		 421 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000106487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2403  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  38.8 
 
 		 822 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1704  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.36 
 
 		 754 aa  165  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3583  ATPase  33.33 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1328  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  25.73 
 
 		 796 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0992  McrB domain-containing protein  36.01 
 
 		 587 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0192465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2840  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  29.01 
 
 		 741 aa  152  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.241934 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3299  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.5 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.43 
 
 		 502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00614825  hitchhiker  0.000290238 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  37.87 
 
 		 853 aa  149  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3198  ATPase  36.43 
 
 		 700 aa  148  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0922607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1385  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.17 
 
 		 683 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7822  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  37.14 
 
 		 698 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2864  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.93 
 
 		 568 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.79325 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0025  ATPase  35.49 
 
 		 629 aa  145  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1010  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.03 
 
 		 765 aa  144  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000291313  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4769  ATPase  37.96 
 
 		 899 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.361924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6961  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.25 
 
 		 626 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00535787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0975  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.09 
 
 		 743 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0514038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  43.72 
 
 		 743 aa  137  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2660  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  35.4 
 
 		 678 aa  135  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.928505  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0028  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  23.97 
 
 		 751 aa  134  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4510  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.98 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.842895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0880  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  29.51 
 
 		 638 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0193575  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3271  hypothetical protein  34.14 
 
 		 705 aa  132  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0401117  normal  0.182114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1298  ATPase  34.73 
 
 		 999 aa  127  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00022527  normal  0.161034 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0951  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.17 
 
 		 590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3670  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.05 
 
 		 685 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4532  ATPase  33.76 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.228072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3331  ATPase  32.9 
 
 		 685 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0004  hypothetical protein  37.22 
 
 		 845 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00169415  unclonable  0.0000000310884 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3503  AAA_5 ATPase  28.71 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2910  ATPase  38.64 
 
 		 900 aa  112  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2235  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.67 
 
 		 585 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.89284  hitchhiker  0.0000945382 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2668  ATPase  33.79 
 
 		 303 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00285802  normal  0.904781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1973  ATPase  35.19 
 
 		 450 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0978731  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4620  ATPase  36.21 
 
 		 862 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00433872  decreased coverage  0.0000000142009 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0174  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  36.41 
 
 		 603 aa  107  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1590  AAA_5 ATPase  40.54 
 
 		 834 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0784  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.57 
 
 		 398 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1239  hypothetical protein  35.56 
 
 		 687 aa  107  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.793158  hitchhiker  0.00100345 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0134  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  36.42 
 
 		 662 aa  105  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.805752  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7438  GTPase subunit of restriction endonuclease-like  35.27 
 
 		 696 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3469  hypothetical protein  29 
 
 		 851 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0603195  normal  0.212909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3725  ATPas  35.33 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3308  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.46 
 
 		 723 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.506634 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2031  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  34.36 
 
 		 481 aa  101  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0504678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1653  hypothetical protein  36.57 
 
 		 517 aa  101  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0971  McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit, putative  44.17 
 
 		 571 aa  99  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.361616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1980  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  35.71 
 
 		 605 aa  98.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.221935  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0152  putative McrBC restriction endonuclease system, McrB subunit  37.66 
 
 		 598 aa  95.5  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.264336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1562  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.17 
 
 		 603 aa  93.6  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0252  ATPase  32.06 
 
 		 498 aa  92  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.712243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0226  endonuclease  32.83 
 
 		 498 aa  91.3  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4727  GTPase subunit of restriction endonuclease-like protein  35.29 
 
 		 722 aa  91.3  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.162949  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0822  polysulfide reductase chain C (sulfur reductase chain C)  31.58 
 
 		 412 aa  87.8  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000697352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4335  R1.LlaJI  28.17 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0970612  hitchhiker  0.000000213908 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1909  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.23 
 
 		 795 aa  82.8  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0817  ATPase  30.23 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1009  type II restriction-modification system restriction subunit  29.63 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.61014e-61 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0536  ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  27.78 
 
 		 653 aa  80.1  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000638897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3008  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.85 
 
 		 449 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506367 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0958  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.55 
 
 		 651 aa  73.9  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000872782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.77 
 
 		 510 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0293694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2266  ATPase  32.96 
 
 		 803 aa  73.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1053  ATPase  32.39 
 
 		 523 aa  72.4  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.603764 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1354  hypothetical protein  53.97 
 
 		 64 aa  72.8  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0379  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.63 
 
 		 410 aa  70.5  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3352  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.34 
 
 		 748 aa  66.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0015  putative 5-methylcytosine-specific restriction enzyme B  23.99 
 
 		 597 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2172  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.53 
 
 		 559 aa  61.6  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3015  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.27 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1291  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.34 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.902776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0788  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.86 
 
 		 668 aa  60.8  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1826  ATPase  27.41 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1858  ATPase  32.2 
 
 		 524 aa  56.6  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.365948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5205  AAA ATPase  29.28 
 
 		 371 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1096  hypothetical protein  28.93 
 
 		 844 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1453  hypothetical protein  25.4 
 
 		 564 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115267  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0873  hypothetical protein  28.34 
 
 		 847 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0927  hypothetical protein  28.34 
 
 		 843 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1023  ATPase  26.51 
 
 		 599 aa  53.5  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0862859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0970  ATPase, AAA family  28.34 
 
 		 844 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1992  ATPase  27.72 
 
 		 589 aa  52.4  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.92 
 
 		 606 aa  52.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1016  5-methylcytosine-specific restriction related enzyme  29.19 
 
 		 792 aa  52  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0069  ATPase  29.05 
 
 		 475 aa  52  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.977375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2183  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.98 
 
 		 819 aa  51.2  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.192333 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1001  ATPase  29.21 
 
 		 474 aa  50.8  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00172806  hitchhiker  0.00521543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>