More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4672 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  92.07 
 
 
290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  91.72 
 
 
290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  92.07 
 
 
290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  91.03 
 
 
290 aa  559  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  91.72 
 
 
290 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  91.38 
 
 
290 aa  554  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  90.69 
 
 
290 aa  552  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  89.66 
 
 
290 aa  549  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  89.66 
 
 
290 aa  549  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  67.93 
 
 
292 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  53.29 
 
 
291 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  51.9 
 
 
291 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  51.72 
 
 
280 aa  317  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 
286 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 
285 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  40.42 
 
 
287 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  39.93 
 
 
287 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  40.34 
 
 
287 aa  225  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  42.18 
 
 
281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  41.64 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  43.81 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 
281 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 
289 aa  215  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  35.76 
 
 
288 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 
292 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
313 aa  205  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
281 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  37.72 
 
 
290 aa  203  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 
285 aa  201  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 
288 aa  198  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  40.6 
 
 
301 aa  198  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 
285 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 
315 aa  185  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  41.88 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  33.56 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
280 aa  162  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  34.25 
 
 
281 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  44.9 
 
 
200 aa  139  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  47.22 
 
 
265 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
300 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 
300 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
300 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 
300 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  32.02 
 
 
313 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 
279 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  25.52 
 
 
279 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  35.19 
 
 
160 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  26.57 
 
 
279 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
298 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  23.33 
 
 
302 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  28.03 
 
 
279 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  25.08 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  23.73 
 
 
277 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 
277 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  22.57 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  22.57 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  24.67 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 
129 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 
286 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 
452 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 
140 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  23.61 
 
 
294 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  22.26 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  24.23 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  22.22 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  25.43 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  23.18 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  23.73 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 
271 aa  79  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3013  transcription activator, effector binding  22.97 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  35.29 
 
 
113 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  35.29 
 
 
113 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  35.29 
 
 
113 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>