More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0808 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  95.31 
 
 		 405 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  99.01 
 
 		 405 aa  773    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  781    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  89.58 
 
 		 410 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  89.33 
 
 		 410 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  100 
 
 		 405 aa  781    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  87.59 
 
 		 410 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  76.69 
 
 		 413 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  77.69 
 
 		 414 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  76.19 
 
 		 413 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  75.74 
 
 		 430 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  75.99 
 
 		 412 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  75.99 
 
 		 430 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  75.99 
 
 		 412 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  75.74 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  76.49 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  75.74 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  75.74 
 
 		 412 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  57.36 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  53.63 
 
 		 418 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 420 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  38.36 
 
 		 420 aa  242  7e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  35.06 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  29.82 
 
 		 415 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  37.93 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 395 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  33.52 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 434 aa  129  6e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  31.87 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  31.68 
 
 		 493 aa  123  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 431 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  27.11 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  28.1 
 
 		 420 aa  102  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  26 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 417 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  30.55 
 
 		 450 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 446 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  21.91 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  30.27 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  22.43 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.54 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  24.54 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  21.07 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  25.58 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  26.27 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  25.09 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  25.88 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  26.02 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  30 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  27 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  27.08 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  25.67 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  25.37 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.95 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  27.6 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  23.45 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>