172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6172 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  80.27 
 
 
462 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  79.56 
 
 
494 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  100 
 
 
463 aa  919    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
464 aa  922    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  65.32 
 
 
454 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  67.41 
 
 
462 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  61.73 
 
 
458 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  64.27 
 
 
454 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  60.62 
 
 
450 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  63.97 
 
 
461 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  60.4 
 
 
450 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  64.37 
 
 
454 aa  508  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  59.42 
 
 
449 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  65.17 
 
 
476 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  58.35 
 
 
457 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  58.8 
 
 
459 aa  487  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  64.14 
 
 
454 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  56.7 
 
 
460 aa  451  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  66.67 
 
 
359 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  44.4 
 
 
501 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  39.87 
 
 
451 aa  299  7e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  32.41 
 
 
449 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  35.78 
 
 
454 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  40.19 
 
 
458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  34.53 
 
 
447 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  30.53 
 
 
449 aa  194  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  36.49 
 
 
458 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  34.93 
 
 
442 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  35.31 
 
 
457 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  34.28 
 
 
456 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  28.64 
 
 
446 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  35.31 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.93 
 
 
445 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  33.89 
 
 
443 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  31.66 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  35.14 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  34.04 
 
 
451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  27.73 
 
 
446 aa  173  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  28.67 
 
 
446 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  32.37 
 
 
483 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  32.23 
 
 
481 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  32.79 
 
 
450 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  28.38 
 
 
453 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  35.85 
 
 
456 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 
488 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  29.1 
 
 
456 aa  161  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  34.35 
 
 
458 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.17 
 
 
468 aa  158  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  32.82 
 
 
486 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  33.88 
 
 
458 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  34.27 
 
 
461 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.73 
 
 
481 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  32.45 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  28.95 
 
 
482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  32.05 
 
 
463 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  36.66 
 
 
482 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  36.24 
 
 
463 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  29.86 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  32.55 
 
 
456 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  32.74 
 
 
449 aa  137  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  28.89 
 
 
504 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  32.24 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  36.96 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  33.04 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  32.68 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  28.99 
 
 
490 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  31.93 
 
 
470 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  32.12 
 
 
477 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  32.23 
 
 
441 aa  129  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  31.49 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  29.21 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  27.19 
 
 
481 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  30.92 
 
 
474 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.41 
 
 
467 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  30.73 
 
 
503 aa  123  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  25.33 
 
 
469 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  30.73 
 
 
503 aa  123  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  25.54 
 
 
449 aa  123  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4513  MmgE/PrpD family protein  29.13 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0208736  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  32.16 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  31.19 
 
 
503 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  34.17 
 
 
464 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  26.73 
 
 
485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3206  MmgE/PrpD family protein  33.84 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  30.89 
 
 
465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  29.61 
 
 
461 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  26.81 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  26.62 
 
 
453 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  29.29 
 
 
461 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  32.82 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  29.16 
 
 
453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  29.77 
 
 
471 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 
450 aa  113  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  32.63 
 
 
447 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  31.39 
 
 
454 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  31.83 
 
 
453 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  24.57 
 
 
457 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  28.91 
 
 
451 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  29.62 
 
 
489 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  29.36 
 
 
449 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>