More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5259 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  68.06 
 
 		 834 aa  953    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  66.15 
 
 		 846 aa  855    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  61.53 
 
 		 810 aa  859    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  98.65 
 
 		 743 aa  1484    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  70.82 
 
 		 844 aa  988    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 743 aa  1508    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  70.82 
 
 		 839 aa  989    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  70.92 
 
 		 844 aa  988    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  72.16 
 
 		 698 aa  992    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  67.16 
 
 		 850 aa  917    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  70.82 
 
 		 844 aa  988    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  64.34 
 
 		 846 aa  877    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  70.82 
 
 		 928 aa  988    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  64.63 
 
 		 846 aa  880    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  68.04 
 
 		 821 aa  989    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  89.64 
 
 		 732 aa  1322    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  93 
 
 		 742 aa  1402    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  71.84 
 
 		 862 aa  1030    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  70.82 
 
 		 839 aa  988    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  60.15 
 
 		 841 aa  816    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  71.43 
 
 		 787 aa  976    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  71.99 
 
 		 858 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  58.45 
 
 		 678 aa  764    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  57.32 
 
 		 675 aa  782    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  63.48 
 
 		 801 aa  874    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  68.5 
 
 		 838 aa  973    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  68.79 
 
 		 826 aa  940    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 743 aa  1508    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  72.34 
 
 		 857 aa  1018    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  84.12 
 
 		 787 aa  1252    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  70.82 
 
 		 844 aa  988    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  72.71 
 
 		 888 aa  1017    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  57.45 
 
 		 686 aa  776    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  73.97 
 
 		 857 aa  1041    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  73.97 
 
 		 870 aa  1040    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  90.53 
 
 		 728 aa  1318    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  72.34 
 
 		 857 aa  1018    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  47 
 
 		 783 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.52 
 
 		 850 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  41.47 
 
 		 755 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  41.42 
 
 		 774 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  41.42 
 
 		 762 aa  451  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  40.59 
 
 		 730 aa  452  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  36.81 
 
 		 743 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  40.45 
 
 		 760 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  40.62 
 
 		 750 aa  444  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  40.57 
 
 		 752 aa  435  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  37.39 
 
 		 854 aa  416  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  35.83 
 
 		 740 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  33.88 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  34.21 
 
 		 786 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.4 
 
 		 794 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.69 
 
 		 772 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  34.73 
 
 		 762 aa  399  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.95 
 
 		 907 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.71 
 
 		 786 aa  395  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  35.06 
 
 		 759 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 768 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  36.01 
 
 		 767 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  33.43 
 
 		 785 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.19 
 
 		 773 aa  363  5.0000000000000005e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  33.38 
 
 		 776 aa  360  5e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  35.05 
 
 		 765 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  35.15 
 
 		 792 aa  339  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  35.17 
 
 		 791 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  32.3 
 
 		 777 aa  319  9e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  32.87 
 
 		 779 aa  319  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  32.73 
 
 		 794 aa  319  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  35.58 
 
 		 681 aa  317  4e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 766 aa  317  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  33.43 
 
 		 777 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  33.43 
 
 		 777 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  34.18 
 
 		 771 aa  316  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  36.03 
 
 		 679 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  33.47 
 
 		 801 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  33.04 
 
 		 797 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  33.43 
 
 		 804 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  32.55 
 
 		 799 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  32.13 
 
 		 793 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  32.4 
 
 		 839 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  32.13 
 
 		 793 aa  308  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 661 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  32.21 
 
 		 839 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  32.21 
 
 		 839 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  32.21 
 
 		 839 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  32.35 
 
 		 839 aa  306  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  32.36 
 
 		 778 aa  305  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  34.75 
 
 		 687 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  32.03 
 
 		 838 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  31.84 
 
 		 837 aa  302  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  33.15 
 
 		 803 aa  301  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 		 793 aa  301  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  33.61 
 
 		 824 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  33.83 
 
 		 804 aa  300  8e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  32.7 
 
 		 796 aa  299  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  33.47 
 
 		 824 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  33.02 
 
 		 683 aa  298  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  32.04 
 
 		 852 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  31.9 
 
 		 840 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  31.9 
 
 		 840 aa  297  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>