181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3821 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
407 aa  756    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  41.71 
 
 
601 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  39.69 
 
 
598 aa  244  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  39.37 
 
 
637 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  38.5 
 
 
622 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  41.86 
 
 
601 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  41.15 
 
 
608 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  37.4 
 
 
599 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  41.34 
 
 
601 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  37.7 
 
 
597 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  40.64 
 
 
602 aa  235  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  40.96 
 
 
602 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  41.6 
 
 
599 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  38.06 
 
 
619 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  37.2 
 
 
760 aa  231  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  38.32 
 
 
651 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  38.18 
 
 
616 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  37.85 
 
 
607 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  39.69 
 
 
611 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.44 
 
 
669 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  39.04 
 
 
666 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  39.69 
 
 
611 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  35.14 
 
 
611 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  38.74 
 
 
764 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  38.68 
 
 
670 aa  219  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  38.68 
 
 
670 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  38.68 
 
 
673 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  38.48 
 
 
763 aa  215  9e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  43.43 
 
 
584 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 
643 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  40.15 
 
 
719 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  38.42 
 
 
625 aa  206  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  36.59 
 
 
604 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 
596 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  37.68 
 
 
702 aa  203  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  36.11 
 
 
569 aa  202  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.67 
 
 
596 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  40.1 
 
 
852 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  33.67 
 
 
596 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.67 
 
 
596 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.67 
 
 
596 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.67 
 
 
596 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  37.66 
 
 
660 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  37.66 
 
 
660 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  37.66 
 
 
660 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  37.66 
 
 
660 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.67 
 
 
596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  38.98 
 
 
616 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  38.38 
 
 
617 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  36.08 
 
 
640 aa  189  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  33.16 
 
 
595 aa  189  9e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  37.47 
 
 
623 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 
741 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  34.06 
 
 
607 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  34.01 
 
 
641 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  38.28 
 
 
637 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  30.13 
 
 
610 aa  172  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  34.69 
 
 
652 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  34.69 
 
 
652 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  38.13 
 
 
609 aa  166  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 
629 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  28.42 
 
 
612 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  31.48 
 
 
606 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  36.2 
 
 
640 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  30.62 
 
 
625 aa  153  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  34.02 
 
 
628 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  38.42 
 
 
660 aa  145  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  34.81 
 
 
639 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  35.2 
 
 
617 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  34.73 
 
 
630 aa  142  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  35.41 
 
 
421 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  35.38 
 
 
620 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 
414 aa  126  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.25 
 
 
399 aa  126  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.34 
 
 
399 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.7 
 
 
414 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  33.92 
 
 
628 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.29 
 
 
401 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  30.29 
 
 
401 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  31.97 
 
 
617 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  35.4 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  33.04 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  32.83 
 
 
626 aa  119  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.12 
 
 
414 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  35.06 
 
 
421 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  29.41 
 
 
574 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  27.25 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  26.73 
 
 
485 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0021  sodium/hydrogen exchanger  22.83 
 
 
484 aa  63.9  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  25.96 
 
 
596 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  25.96 
 
 
597 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3316  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
420 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5712  putative cell volume regulation protein A  48.61 
 
 
82 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0175754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  28.42 
 
 
486 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  26.25 
 
 
509 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0702  sodium/hydrogen exchanger  30.38 
 
 
411 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  26.61 
 
 
616 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  25.88 
 
 
592 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  23.59 
 
 
498 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  26.34 
 
 
597 aa  57.4  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>