More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5200 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2668  serine hydroxymethyltransferase  93.48 
 
 		 415 aa  803    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0729  serine hydroxymethyltransferase  85.06 
 
 		 415 aa  731    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1660  serine hydroxymethyltransferase  78.26 
 
 		 414 aa  678    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.445565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  78.31 
 
 		 421 aa  673    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0615  Glycine hydroxymethyltransferase  80.92 
 
 		 415 aa  696    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0279  serine hydroxymethyltransferase  76.57 
 
 		 414 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2075  serine hydroxymethyltransferase  93.48 
 
 		 415 aa  803    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3363  serine hydroxymethyltransferase  99.28 
 
 		 415 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  77.35 
 
 		 416 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3196  serine hydroxymethyltransferase  93.48 
 
 		 415 aa  803    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  84.54 
 
 		 415 aa  733    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2992  serine hydroxymethyltransferase  77.54 
 
 		 414 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2165  serine hydroxymethyltransferase  78.74 
 
 		 414 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.675395  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  85.27 
 
 		 415 aa  732    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3250  serine hydroxymethyltransferase  93.48 
 
 		 415 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  79.95 
 
 		 415 aa  688    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3895  serine hydroxymethyltransferase  94.93 
 
 		 415 aa  796    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2754  serine hydroxymethyltransferase  95.89 
 
 		 415 aa  803    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2449  serine hydroxymethyltransferase  92.75 
 
 		 415 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  92.75 
 
 		 415 aa  783    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  76.87 
 
 		 414 aa  672    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1379  serine hydroxymethyltransferase  92.51 
 
 		 415 aa  798    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2044  serine hydroxymethyltransferase  78.26 
 
 		 414 aa  678    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110649  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4955  glycine hydroxymethyltransferase  81.64 
 
 		 415 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  76.09 
 
 		 414 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3100  serine hydroxymethyltransferase  77.29 
 
 		 414 aa  676    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0722  serine hydroxymethyltransferase  85.02 
 
 		 436 aa  729    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59476  normal  0.142236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1917  serine hydroxymethyltransferase  71.74 
 
 		 430 aa  634    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.584505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  76.81 
 
 		 414 aa  675    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  91.3 
 
 		 415 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2907  serine hydroxymethyltransferase  76.09 
 
 		 414 aa  671    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.0486853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0700  serine hydroxymethyltransferase  97.1 
 
 		 431 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0504784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  85.27 
 
 		 508 aa  728    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0323  serine hydroxymethyltransferase  95.17 
 
 		 415 aa  798    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2581  serine hydroxymethyltransferase  95.17 
 
 		 415 aa  796    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.848716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1551  serine hydroxymethyltransferase  77.83 
 
 		 416 aa  674    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1942  serine hydroxymethyltransferase  93.48 
 
 		 415 aa  803    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3234  serine hydroxymethyltransferase  93.24 
 
 		 415 aa  802    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  97.34 
 
 		 431 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5200  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 415 aa  855    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0775  serine hydroxymethyltransferase  95.17 
 
 		 415 aa  796    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0739852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  95.17 
 
 		 415 aa  798    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0834  serine hydroxymethyltransferase  93.48 
 
 		 415 aa  803    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4246  glycine hydroxymethyltransferase  72.46 
 
 		 438 aa  625  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.499232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  72.48 
 
 		 454 aa  608  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  70.66 
 
 		 438 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  69.93 
 
 		 416 aa  596  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  65.87 
 
 		 416 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 417 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  65.61 
 
 		 417 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  66.59 
 
 		 417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  66.83 
 
 		 417 aa  571  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  64.98 
 
 		 417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 417 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  65.61 
 
 		 417 aa  570  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  65.37 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  65.37 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  65.77 
 
 		 417 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 		 417 aa  569  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  65.94 
 
 		 417 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 417 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  65.12 
 
 		 417 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  64.75 
 
 		 417 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0295  serine hydroxymethyltransferase  65.54 
 
 		 414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  64.96 
 
 		 417 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0471  serine hydroxymethyltransferase  65.54 
 
 		 414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.937307  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1912  serine hydroxymethyltransferase  66.42 
 
 		 430 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.637321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  65.31 
 
 		 418 aa  558  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  64.9 
 
 		 417 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  64.96 
 
 		 417 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3638  serine hydroxymethyltransferase  63.88 
 
 		 417 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  64.63 
 
 		 417 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  64.22 
 
 		 412 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1851  serine hydroxymethyltransferase  65.43 
 
 		 417 aa  555  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  64.99 
 
 		 417 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  64.51 
 
 		 417 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2796  serine hydroxymethyltransferase  64.35 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2817  serine hydroxymethyltransferase  64.59 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  63.94 
 
 		 417 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  64.79 
 
 		 419 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2755  serine hydroxymethyltransferase  64.59 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.418331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2710  serine hydroxymethyltransferase  64.59 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  63.94 
 
 		 417 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2930  serine hydroxymethyltransferase  64.59 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  63.22 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 417 aa  544  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  66.34 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  63.7 
 
 		 417 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1117  Glycine hydroxymethyltransferase  63.4 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  61.87 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1265  serine hydroxymethyltransferase  62.2 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000077829  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1158  serine hydroxymethyltransferase  61.96 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000444868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>