More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0866 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  100 
 
 		 320 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  99.38 
 
 		 393 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  99.06 
 
 		 320 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  99.38 
 
 		 320 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  99.06 
 
 		 320 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  99.04 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  98.63 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  90.74 
 
 		 333 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  78.84 
 
 		 313 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  78.67 
 
 		 304 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  78.79 
 
 		 303 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  78.45 
 
 		 303 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  78.45 
 
 		 303 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  73.52 
 
 		 322 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  73.52 
 
 		 330 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  83.46 
 
 		 304 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  81.25 
 
 		 304 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  73.85 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  47.5 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  47.5 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  44.98 
 
 		 297 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  40.68 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  42.51 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  41.2 
 
 		 296 aa  212  7e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  41.49 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  39.39 
 
 		 324 aa  205  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  37.92 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  43.75 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  35.77 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  36.39 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.57 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  37.41 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  38.72 
 
 		 316 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  36.53 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  37.97 
 
 		 339 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  35.81 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  33.46 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.59 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  37.87 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  35.93 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  37.5 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  35.09 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  34.8 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.5 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  35.47 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  29.37 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.23 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  27.17 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  32.05 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.08 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  29.5 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 		 307 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  31.02 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.91 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  31.25 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  27.78 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  31.15 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  31.73 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1278  periplasmic solute binding protein  29.37 
 
 		 315 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  29.09 
 
 		 291 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  27.94 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 292 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.84 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  29.06 
 
 		 305 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  28.84 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1533  manganese ABC transporter, manganese-binding adhesion liprotein  26.43 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  31.17 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  26.8 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5758  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 		 319 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0625952  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.28 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  28.85 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  31.05 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25.71 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  28.9 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  30.05 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  25.89 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 		 304 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  29.65 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.6 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  29.62 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0328  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  29.91 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  28.9 
 
 		 322 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>