More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0990 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0990  heavy metal sensor kinase  100 
 
 
161 aa  324  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139531  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  62.03 
 
 
479 aa  193  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  66.2 
 
 
485 aa  193  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  62.18 
 
 
482 aa  190  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  64.05 
 
 
494 aa  189  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  62.18 
 
 
482 aa  190  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  64.05 
 
 
494 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  64.05 
 
 
494 aa  188  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  54.55 
 
 
481 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  51.77 
 
 
473 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2304  two-component sensor  89.33 
 
 
280 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1074  Signal transduction histidine kinase  89.33 
 
 
273 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  48.03 
 
 
485 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2068  heavy metal sensor signal transduction histidine Kinases (STHK)  47.02 
 
 
484 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178003  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6518  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  49.62 
 
 
484 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  44.27 
 
 
454 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 
465 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.64 
 
 
454 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
458 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 
470 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  41.98 
 
 
454 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
461 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  41.35 
 
 
461 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000221939  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  40.6 
 
 
461 aa  100  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000557758  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0136  sensor protein irlS  83.33 
 
 
199 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3560  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
444 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0861327  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0511  signal transduction histidine kinase  83.33 
 
 
199 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
457 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
464 aa  87.8  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  36.36 
 
 
481 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  35.61 
 
 
453 aa  82  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  38.24 
 
 
502 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.48 
 
 
466 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
445 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1712  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 
462 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
472 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
469 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
469 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
464 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
463 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
465 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
471 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
480 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
469 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  35.4 
 
 
466 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0135  sensor histidine kinase  97.92 
 
 
49 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
471 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0512  hypothetical protein  97.92 
 
 
49 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.822807  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
467 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  36.84 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  36.84 
 
 
715 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  36.84 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  36.84 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  36.84 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  36.84 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  36.84 
 
 
464 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
450 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  35.77 
 
 
463 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  39.47 
 
 
592 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  33.08 
 
 
470 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
420 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  36.94 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
369 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
467 aa  70.9  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  35.09 
 
 
464 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 
449 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.28 
 
 
469 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  38.71 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  35.16 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  33.94 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  30.4 
 
 
456 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
466 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
481 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  37.74 
 
 
465 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
487 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
381 aa  68.9  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0297  sensor histidine kinase  31.73 
 
 
480 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
413 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
475 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  34.96 
 
 
463 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
462 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  34.38 
 
 
431 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
481 aa  68.6  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  34 
 
 
463 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  33 
 
 
463 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
469 aa  68.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
459 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000440715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  33 
 
 
463 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0304  sensor histidine kinase  31.73 
 
 
469 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0202575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  33 
 
 
462 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2384  sensor histidine kinase  29.22 
 
 
385 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.263036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2573  sensor histidine kinase  29.22 
 
 
385 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000106613 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  33.01 
 
 
463 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
474 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2560  sensor histidine kinase  29.22 
 
 
385 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>