More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1554 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  92.9 
 
 
344 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  92.58 
 
 
310 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  92.26 
 
 
310 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  75.66 
 
 
320 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  75.99 
 
 
320 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6906  ribokinase  76.32 
 
 
328 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135806  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6950  ribokinase  75.99 
 
 
308 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  58.22 
 
 
306 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  59.8 
 
 
314 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  58.33 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  58.33 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  58.33 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  58.33 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  58.33 
 
 
306 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  58.28 
 
 
309 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  60.6 
 
 
315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4487  carbohydrate kinase, PfkB  63.7 
 
 
308 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  60.13 
 
 
315 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  60.13 
 
 
315 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  44.33 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  42.86 
 
 
308 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  41.95 
 
 
306 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  42.56 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  39.8 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  36.51 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  37.05 
 
 
304 aa  189  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  40.61 
 
 
302 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  39.45 
 
 
299 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  43.29 
 
 
309 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  43.29 
 
 
309 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  41.99 
 
 
295 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  39.31 
 
 
310 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  39.14 
 
 
308 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  40.34 
 
 
312 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  41.28 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  43.6 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  40.83 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  39 
 
 
301 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  39.1 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  40.83 
 
 
302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  40.69 
 
 
308 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  40.83 
 
 
321 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  39.45 
 
 
302 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  40.69 
 
 
308 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  42.02 
 
 
321 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  41.33 
 
 
305 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  35.5 
 
 
345 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  37.05 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  40 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  38.85 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  40.2 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  37.42 
 
 
307 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  35.64 
 
 
307 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  43.6 
 
 
308 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  41.03 
 
 
311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  38.87 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  41.03 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  41.03 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  36.96 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  33.66 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  37.59 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  42.64 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  36.96 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  43.25 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  43.25 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0083  ribokinase-like domain-containing protein  41.56 
 
 
324 aa  162  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  39.4 
 
 
319 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  36.58 
 
 
316 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.16 
 
 
305 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  35.86 
 
 
305 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  31.62 
 
 
308 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  33.33 
 
 
305 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  39.39 
 
 
296 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  32.44 
 
 
304 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  37.75 
 
 
302 aa  159  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
308 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  33.45 
 
 
404 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  33.45 
 
 
404 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  33.45 
 
 
404 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  33.45 
 
 
404 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  39.54 
 
 
307 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4447  ribokinase  40.42 
 
 
334 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  41.55 
 
 
310 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  35.66 
 
 
398 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  34.59 
 
 
307 aa  156  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  37.24 
 
 
298 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  33.1 
 
 
404 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  35.14 
 
 
303 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  30.72 
 
 
308 aa  155  8e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  36.9 
 
 
298 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  36.9 
 
 
298 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  36.55 
 
 
298 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  36.73 
 
 
307 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  36.9 
 
 
298 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  40 
 
 
309 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  36.55 
 
 
298 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  34.8 
 
 
303 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  34.8 
 
 
303 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>