More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0702 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  83.98 
 
 
430 aa  689  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
523 aa  1066  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  83.98 
 
 
430 aa  689  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  83.49 
 
 
411 aa  649  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  82.79 
 
 
384 aa  601  1e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  82.51 
 
 
384 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  82.51 
 
 
384 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  82.51 
 
 
384 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  79.83 
 
 
385 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  79.56 
 
 
385 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  79.83 
 
 
385 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  76.29 
 
 
386 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  76.73 
 
 
385 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  75.45 
 
 
385 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  75.19 
 
 
385 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  71.32 
 
 
394 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  67.09 
 
 
386 aa  506  1e-142  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  67.09 
 
 
386 aa  506  1e-142  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  67.09 
 
 
386 aa  507  1e-142  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  66.84 
 
 
386 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  66.84 
 
 
386 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  66.08 
 
 
386 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  66.84 
 
 
386 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  64.86 
 
 
388 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  64.66 
 
 
393 aa  461  1e-128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  64.66 
 
 
393 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  60.65 
 
 
387 aa  452  1e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  59.6 
 
 
390 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  58.4 
 
 
386 aa  439  1e-122  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  60.36 
 
 
386 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  60.54 
 
 
404 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  58.25 
 
 
386 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  60.22 
 
 
386 aa  415  1e-115  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  60.22 
 
 
386 aa  415  1e-115  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  59.51 
 
 
386 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  57.22 
 
 
430 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  56.71 
 
 
430 aa  405  1e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  56.71 
 
 
430 aa  405  1e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  56.96 
 
 
430 aa  407  1e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  56.96 
 
 
430 aa  407  1e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  56.71 
 
 
430 aa  405  1e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  56.53 
 
 
390 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  57.07 
 
 
390 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  57.29 
 
 
390 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  57.49 
 
 
390 aa  400  1e-110  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  57.49 
 
 
390 aa  400  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  56.95 
 
 
390 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  56.95 
 
 
390 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  56.03 
 
 
390 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  56.04 
 
 
376 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  52.44 
 
 
376 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  52.44 
 
 
376 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  52.19 
 
 
376 aa  358  2e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  47.06 
 
 
389 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  45.41 
 
 
397 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  43.59 
 
 
421 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  43.59 
 
 
421 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  48.14 
 
 
389 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  47.86 
 
 
385 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  47.61 
 
 
385 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  45.41 
 
 
397 aa  292  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  45.41 
 
 
397 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  45.41 
 
 
397 aa  291  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  48.11 
 
 
383 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  45.81 
 
 
445 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  47.86 
 
 
383 aa  287  3e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  45.18 
 
 
397 aa  285  2e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  47.36 
 
 
383 aa  284  3e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  47.36 
 
 
383 aa  284  3e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  46.15 
 
 
391 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.15 
 
 
436 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  44.66 
 
 
436 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.8 
 
 
399 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.8 
 
 
399 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.8 
 
 
399 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.48 
 
 
386 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.48 
 
 
386 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.48 
 
 
386 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.48 
 
 
386 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.8 
 
 
399 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.48 
 
 
386 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  43.8 
 
 
399 aa  275  2e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  45.23 
 
 
386 aa  273  4e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  46.05 
 
 
389 aa  273  5e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  44.13 
 
 
391 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  44.74 
 
 
389 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  41.38 
 
 
389 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  9.90839e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  42.09 
 
 
383 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  42.01 
 
 
383 aa  260  5e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  43.4 
 
 
402 aa  260  5e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  43.07 
 
 
381 aa  260  5e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  42.54 
 
 
396 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.36 
 
 
380 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  44.07 
 
 
384 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  44.07 
 
 
384 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  44.07 
 
 
384 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  44.07 
 
 
384 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  44.07 
 
 
384 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  44.07 
 
 
384 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  44.07 
 
 
384 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>