57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3243 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  374  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  59.38 
 
 
252 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  45.62 
 
 
258 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  48.7 
 
 
272 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  49.25 
 
 
265 aa  127  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  51.54 
 
 
313 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  48.89 
 
 
277 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  44.96 
 
 
256 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  45.19 
 
 
268 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  41.36 
 
 
259 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  43.86 
 
 
295 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  40.97 
 
 
334 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  40.3 
 
 
345 aa  101  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  43.57 
 
 
311 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  39.53 
 
 
314 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  42.96 
 
 
323 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  39.17 
 
 
304 aa  91.3  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  39.17 
 
 
304 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  39.06 
 
 
279 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  39.69 
 
 
315 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  42.55 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  33.14 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  34.53 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  38.52 
 
 
323 aa  77.8  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  35.59 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  37.19 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  36.36 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  41 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  36.46 
 
 
298 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  35.23 
 
 
257 aa  68.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  37.5 
 
 
255 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  35.16 
 
 
257 aa  67  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  32.59 
 
 
253 aa  61.6  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0090  hypothetical protein  59.52 
 
 
59 aa  60.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  32.26 
 
 
257 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  37.21 
 
 
271 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  38.46 
 
 
462 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  34.31 
 
 
318 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  34.09 
 
 
309 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  34.09 
 
 
309 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  33.33 
 
 
303 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  31.09 
 
 
358 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
424 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  31.43 
 
 
314 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  34.72 
 
 
304 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  36.14 
 
 
313 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  27.62 
 
 
306 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  34.92 
 
 
416 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0191  hypothetical protein  36.56 
 
 
308 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.314917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1194  hypothetical protein  36.56 
 
 
308 aa  44.7  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  30.22 
 
 
299 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5446  hypothetical protein  34.94 
 
 
108 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.141898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2980  hypothetical protein  34.74 
 
 
308 aa  42  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1364  HNH endonuclease family protein  26.02 
 
 
326 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.163097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4880  hypothetical protein  25.79 
 
 
299 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1002  HNH nuclease  27.5 
 
 
326 aa  41.2  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  27.71 
 
 
262 aa  41.2  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.351588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>