More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0592 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  76.65 
 
 		 682 aa  1095    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 677 aa  1399    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  44.46 
 
 		 607 aa  494  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  42.19 
 
 		 603 aa  489  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  43.03 
 
 		 618 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  42.34 
 
 		 679 aa  473  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  42.95 
 
 		 701 aa  473  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  44.91 
 
 		 599 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  43.35 
 
 		 605 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  43.85 
 
 		 602 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 602 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  43.89 
 
 		 606 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  44.16 
 
 		 593 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  42.81 
 
 		 609 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  42.42 
 
 		 619 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42 
 
 		 597 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  42.07 
 
 		 606 aa  442  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 599 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  43.69 
 
 		 609 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 599 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  41.9 
 
 		 602 aa  439  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 		 615 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 600 aa  435  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 603 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  41.87 
 
 		 599 aa  432  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  43.01 
 
 		 599 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  40.69 
 
 		 600 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  40 
 
 		 611 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 616 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  41.44 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  41.22 
 
 		 622 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  41.6 
 
 		 595 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 		 606 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  40.58 
 
 		 604 aa  418  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  40.5 
 
 		 608 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 597 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  41.91 
 
 		 600 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  40.68 
 
 		 599 aa  413  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  40.48 
 
 		 607 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 		 601 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 597 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 600 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  40.73 
 
 		 597 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 597 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 606 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 		 604 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  39.63 
 
 		 599 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  37.46 
 
 		 606 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  40.65 
 
 		 598 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 		 597 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  39.5 
 
 		 612 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  41.32 
 
 		 591 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 601 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 612 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  39.82 
 
 		 615 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 602 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 597 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 		 596 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  39.34 
 
 		 632 aa  385  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 604 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 604 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 604 aa  336  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 622 aa  336  9e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 592 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 597 aa  332  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 590 aa  330  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 602 aa  327  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 612 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 617 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 594 aa  319  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 606 aa  316  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 606 aa  313  9e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 606 aa  312  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  33.28 
 
 		 605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 603 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 607 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 630 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 633 aa  302  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 590 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 596 aa  298  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 649 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  31.07 
 
 		 592 aa  296  9e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 590 aa  295  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 610 aa  294  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 602 aa  294  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 602 aa  294  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 603 aa  293  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00466238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 602 aa  292  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 612 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 622 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 652 aa  289  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 633 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 610 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 596 aa  286  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.88 
 
 		 610 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2093  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000290316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 597 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 613 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>