58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0299 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  100 
 
 		 408 aa  814    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  63.7 
 
 		 393 aa  502  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  55.15 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  54.43 
 
 		 392 aa  441  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  53.09 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  50.99 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  53.19 
 
 		 414 aa  393  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  50.25 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 		 388 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 394 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 389 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 326 aa  257  3e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 425 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  26.44 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.71 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  23.58 
 
 		 529 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  23.2 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  23.31 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  21.1 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  25.32 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  28.21 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  24.05 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0367  putative transporter  26.37 
 
 		 462 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  20.9 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 386 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.13 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0878  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1573  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  22.29 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  21.28 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  21.62 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  23.55 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  21 
 
 		 274 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  25.14 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  28.48 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 489 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>