More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0029 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  97.25 
 
 
327 aa  659  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  97.86 
 
 
327 aa  667  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  97.86 
 
 
327 aa  664  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  100 
 
 
327 aa  676  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  97.55 
 
 
327 aa  663  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  97.86 
 
 
327 aa  664  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  98.17 
 
 
327 aa  669  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  99.08 
 
 
327 aa  673  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  97.25 
 
 
327 aa  659  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  95.72 
 
 
327 aa  655  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  91.44 
 
 
327 aa  607  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  51.68 
 
 
337 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  51.12 
 
 
330 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  37.23 
 
 
326 aa  232  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.76 
 
 
358 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  3.42072e-10 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.12 
 
 
320 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.90012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  32.92 
 
 
337 aa  169  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  37.58 
 
 
321 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.00228e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.79 
 
 
335 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.71 
 
 
320 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54633e-15 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  41.71 
 
 
320 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0505  DNA-directed DNA polymerase  30.42 
 
 
308 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0518  DNA-directed DNA polymerase  30.42 
 
 
308 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0375901  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.16 
 
 
327 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0446  DNA polymerase III subunit delta'  33.6 
 
 
286 aa  149  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.22 
 
 
344 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  2.88191e-06 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.39 
 
 
318 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0122  DNA polymerase III, delta prime subunit, putative  31.29 
 
 
308 aa  146  4e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.08 
 
 
326 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.87 
 
 
323 aa  142  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.51 
 
 
331 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.82 
 
 
340 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.58 
 
 
330 aa  131  1e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  28.83 
 
 
339 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.71 
 
 
363 aa  127  2e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.71 
 
 
363 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.65 
 
 
478 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.65 
 
 
478 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  34.21 
 
 
287 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.73 
 
 
339 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.53 
 
 
343 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.44 
 
 
335 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.09 
 
 
329 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  30.22 
 
 
499 aa  122  1e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  30.12 
 
 
328 aa  121  2e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.93 
 
 
460 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.32 
 
 
383 aa  120  4e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.21 
 
 
324 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  40.14 
 
 
284 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  8.56784e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.76 
 
 
354 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.88 
 
 
391 aa  119  1e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0527  DNA polymerase III subunit delta'  37.43 
 
 
291 aa  118  1e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.35 
 
 
540 aa  118  1e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  38.89 
 
 
389 aa  118  2e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.85 
 
 
427 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.93 
 
 
517 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0106  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.08 
 
 
586 aa  117  4e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.96 
 
 
559 aa  117  4e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.19 
 
 
589 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.68 
 
 
567 aa  115  7e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0061  DNA-directed DNA polymerase  37.01 
 
 
282 aa  115  1e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.639704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.46 
 
 
527 aa  115  1e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33689e-06 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.55 
 
 
588 aa  115  1e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.71 
 
 
370 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.42 
 
 
351 aa  114  2e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.19 
 
 
522 aa  114  2e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.31 
 
 
447 aa  113  4e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  3.24435e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.51 
 
 
554 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.2733e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  32.37 
 
 
582 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.45747e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.75 
 
 
602 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  39.07 
 
 
328 aa  112  7e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  42.95 
 
 
327 aa  112  7e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  39.07 
 
 
328 aa  112  7e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  4.6762e-05 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.15 
 
 
589 aa  112  7e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.13 
 
 
322 aa  111  1e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  35.45 
 
 
324 aa  112  1e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  28.52 
 
 
326 aa  112  1e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  29.43 
 
 
328 aa  110  2e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.88 
 
 
551 aa  111  2e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.17 
 
 
582 aa  111  2e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  25.8 
 
 
320 aa  111  2e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  32.85 
 
 
579 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.02 
 
 
339 aa  109  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.93 
 
 
328 aa  108  9e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.67 
 
 
561 aa  108  9e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.59056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4573  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.7 
 
 
395 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  35.59 
 
 
328 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  37.59 
 
 
304 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.97 
 
 
610 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.5 
 
 
496 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.48 
 
 
688 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.75 
 
 
547 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  33.67 
 
 
330 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  33.02 
 
 
337 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  38.55 
 
 
328 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 
343 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.35 
 
 
318 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  39.04 
 
 
328 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.33 
 
 
649 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.51 
 
 
467 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>