More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1829 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000709548  normal  0.28873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1836  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.118319  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4363  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8317  Endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1930  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 116 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4268  Endoribonuclease L-PSP  38.61 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  36.52 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 117 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7057  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945657  normal  0.394054 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1080  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  35.29 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  35.54 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 117 aa  72  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  35.05 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  35.05 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  35.05 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  35.05 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  35.05 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  38.54 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  35.78 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  40.96 
 
 		 116 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1654  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00696625  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  35.79 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  40.96 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1649  Endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  37.14 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1979  Endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  36.84 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 116 aa  67  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1289  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  37.76 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  37.23 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  37.11 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  34.75 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  33.93 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  30.7 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  33.01 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 117 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0582  putative Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  35.92 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  30.97 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  35.79 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  31.9 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>