249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1654 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1654  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 118 aa  239  9e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00696625  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  38.83 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  38.83 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 114 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1979  Endoribonuclease L-PSP  42.45 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  39.6 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  41.58 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1649  Endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  41.75 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  44.55 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 114 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2814  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1829  hypothetical protein  36.29 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000709548  normal  0.28873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1162  hypothetical protein  39.6 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  35 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  40.19 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 117 aa  67  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  39.66 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1289  Endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  35.24 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  35.65 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  35.65 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  35.65 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4426  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0537399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  36.75 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  35.65 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  35.65 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  38.83 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  37 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  43.82 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  34.95 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  38.83 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  31.82 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0349  endoribonuclease L-PSP family protein  40 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.682229  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  34.48 
 
 		 116 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  35.54 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0372  endoribonuclease L-PSP family protein  38.82 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  37.62 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  35.35 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  35.34 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  36.63 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1930  endoribonuclease L-PSP  36.05 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  36.45 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4363  endoribonuclease L-PSP  36.14 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  38.61 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  38.61 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1989  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2203  endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000019478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  34.38 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>