229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51450 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_51450  gluconolactonase  100 
 
 
284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3831  senescence marker protein-30 (SMP-30)  53.31 
 
 
283 aa  296  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.209779  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3491  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  53.52 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  52.48 
 
 
280 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1240  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  51.57 
 
 
286 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.138164 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3876  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  47.18 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3138  gluconolactonase  46.83 
 
 
279 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.840697  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3297  response regulator receiver protein  48.77 
 
 
279 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.818338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2136  putative gluconolactonase  42.81 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3075  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.07 
 
 
310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.158339  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3588  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  38.75 
 
 
292 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2046  putative Smp-30/Cgr1 family protein  40.94 
 
 
395 aa  188  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00767899  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2130  Smp-30/Cgr1 family protein, putative  40.94 
 
 
395 aa  188  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.111532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0500  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.55 
 
 
295 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.922972 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0784  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.65 
 
 
302 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0543  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  38.69 
 
 
295 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1271  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.89 
 
 
344 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0150049  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0435  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.41 
 
 
294 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.369431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0916  calcium-binding protein regucalcin  38.24 
 
 
293 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1433  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.19 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00122  regucalcin  38.31 
 
 
303 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235017  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1273  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  37.19 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.753643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.62 
 
 
335 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2143  hypothetical protein  35.9 
 
 
291 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1987  SMP-30/CGR1 family protein  32.04 
 
 
288 aa  149  4e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5895  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.17 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0487304 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0015  gluconolactonase  31.69 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2584  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.82 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2994  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.73 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412095  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3531  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  32.53 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2755  hypothetical protein  37.63 
 
 
303 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.334703  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3586  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.58 
 
 
569 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.63579  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1725  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.11 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0000166829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1170  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain protein  35.84 
 
 
293 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482172  normal  0.0648021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3300  gluconolactonase  34.49 
 
 
291 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.875463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1188  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.99 
 
 
292 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227591  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1813  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.85 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.869871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0279  gluconolactonase  34.05 
 
 
295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.27578  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6028  transcriptional regulator, IclR family  33.69 
 
 
546 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0187184  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4078  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.07 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4190  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.07 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3534  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.34 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0305763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4241  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.81 
 
 
293 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.557262  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  34.75 
 
 
296 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3407  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.43 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13947  normal  0.0742686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1592  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.84 
 
 
300 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1204  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.13 
 
 
293 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  33.9 
 
 
297 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2611  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  37.14 
 
 
309 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.170386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0453  gluconolactonase  34.3 
 
 
289 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3664  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.8 
 
 
304 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000466286  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1323  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  35.23 
 
 
287 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198758  normal  0.707681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4867  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.86 
 
 
309 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0126426  normal  0.175747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1799  gluconolactonase  34.86 
 
 
309 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328228  hitchhiker  0.000281102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0519  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.21 
 
 
285 aa  122  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2566  regucalcin family protein  29.23 
 
 
300 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2591  gluconolactonase  36.03 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000189317  normal  0.0284024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0550  L-arabinonolactonase  36.79 
 
 
304 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621286  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17570  gluconolactonase  32.75 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0137637  normal  0.639926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2014  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.56 
 
 
289 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.169753  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2759  regucalcin family protein  28.87 
 
 
300 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000386621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.99 
 
 
289 aa  118  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1362  Xylono-1,4-lactonase  32.37 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1052  senescence marker protein-30 family protein  34.03 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4580  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.47 
 
 
300 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.47 
 
 
300 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0439453  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1567  senescence marker protein-30 (SMP-30)  31.15 
 
 
294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.382911  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  33.68 
 
 
303 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1727  gluconolactonase  30.26 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2339  regucalcin-like protein  28.83 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6939  gluconolactonase  30.69 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000441161  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2046  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.62 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00681526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5252  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.85 
 
 
281 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5221  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.57 
 
 
300 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5638  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.57 
 
 
300 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2373  regucalcin-like protein  28.17 
 
 
303 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2084  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.55 
 
 
300 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206563  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3696  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.38 
 
 
296 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2186  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.41 
 
 
292 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2356  senescence marker protein-30 family protein  33.95 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2649  regucalcin family protein  28.17 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00899995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0063  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.6 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2001  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.24 
 
 
302 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00903181  hitchhiker  0.0000000314659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4591  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.92 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0901  senescence marker protein-30 (SMP-30)  32.06 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.936604  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1143  gluconolactonase  34.39 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1058  senescence marker protein-30 family protein  34.39 
 
 
311 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0622  senescence marker protein-30 family protein  34.39 
 
 
311 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0845  senescence marker protein-30 family protein  34.39 
 
 
311 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1810  senescence marker protein-30 family protein  34.39 
 
 
311 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4143  gluconolactonase  30.83 
 
 
291 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670498  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2611  regucalcin family protein  28.67 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00251849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4002  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.56 
 
 
293 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0479  senescence marker protein-30 (SMP-30)  30.94 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0398  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.04 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.993472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1292  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.71 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3209  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.62 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0193044 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5506  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  32.48 
 
 
293 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2088  hypothetical protein  31.05 
 
 
300 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000545594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0220  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.9 
 
 
311 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>