More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49910 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  100 
 
 
246 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  79.83 
 
 
251 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  79.83 
 
 
251 aa  371  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  62.8 
 
 
253 aa  297  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  64 
 
 
249 aa  282  4e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  56.97 
 
 
253 aa  279  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  56.22 
 
 
250 aa  273  2e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 
251 aa  269  3e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  58.7 
 
 
251 aa  269  3e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.00734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
251 aa  268  6e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
251 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  3.08196e-06  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  59.59 
 
 
245 aa  265  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  54.44 
 
 
250 aa  265  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  52.44 
 
 
246 aa  265  5e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
251 aa  264  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2064  triosephosphate isomerase  53.82 
 
 
250 aa  264  9e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  58.33 
 
 
251 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
248 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1140  triosephosphate isomerase  63.05 
 
 
248 aa  263  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.766646  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  57.49 
 
 
248 aa  262  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  57.6 
 
 
249 aa  262  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  60.41 
 
 
245 aa  262  5e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  57.49 
 
 
251 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  57.49 
 
 
251 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  7.85898e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  57.49 
 
 
248 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  59.18 
 
 
245 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  58.78 
 
 
248 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  53.41 
 
 
256 aa  259  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  8.20066e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  57.89 
 
 
266 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  56.28 
 
 
249 aa  255  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  56.91 
 
 
251 aa  254  1e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 
250 aa  254  1e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  51.41 
 
 
249 aa  253  2e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  55.28 
 
 
251 aa  251  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  56.68 
 
 
251 aa  251  8e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1296  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
266 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  54.03 
 
 
254 aa  249  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0410  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
266 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0740  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
266 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1127  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
266 aa  249  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1832  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
251 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 
253 aa  249  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  2.44559e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1432  triosephosphate isomerase  57.89 
 
 
251 aa  248  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.515426  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
256 aa  248  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  53.23 
 
 
254 aa  247  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  52.21 
 
 
255 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  52.34 
 
 
252 aa  245  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51.21 
 
 
250 aa  245  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  53.63 
 
 
252 aa  245  5e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  57.43 
 
 
250 aa  245  5e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 
255 aa  245  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  57.43 
 
 
250 aa  244  7e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4150  triosephosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  244  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5374  triosephosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  244  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4453  triosephosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  244  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03753  hypothetical protein  51 
 
 
255 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03804  triosephosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  244  9e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4359  triosephosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  244  9e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4399  triosephosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  244  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4099  triosephosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  244  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4066  Triose-phosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  244  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  54.51 
 
 
258 aa  244  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
249 aa  243  1e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 
249 aa  244  1e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4480  triosephosphate isomerase  51 
 
 
255 aa  243  2e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  51.61 
 
 
250 aa  243  2e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  51.43 
 
 
255 aa  243  2e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  54.72 
 
 
250 aa  243  2e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4052  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
255 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 
250 aa  242  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  52.24 
 
 
255 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  54.55 
 
 
259 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  50 
 
 
260 aa  242  4e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.78614e-07  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  50.57 
 
 
260 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.57421e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  50.57 
 
 
260 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.71764e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  50.57 
 
 
260 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  8.76569e-08  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  50.57 
 
 
260 aa  241  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  8.4878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  50.57 
 
 
260 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21721e-05  unclonable  5.28037e-12 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  50 
 
 
260 aa  241  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  50 
 
 
260 aa  241  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  50 
 
 
260 aa  241  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.72651e-05  hitchhiker  5.21404e-05 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4327  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
255 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4412  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
255 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0292909  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4410  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
255 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4297  triosephosphate isomerase  50.6 
 
 
255 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
251 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 
250 aa  239  3e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  52.67 
 
 
255 aa  239  3e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  50 
 
 
250 aa  239  3e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  55.56 
 
 
270 aa  238  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  49.04 
 
 
260 aa  238  6e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  48.66 
 
 
260 aa  238  6e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.92621e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  49.81 
 
 
260 aa  238  8e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4118  triosephosphate isomerase  51.02 
 
 
255 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 
255 aa  237  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0095  triosephosphate isomerase  51.02 
 
 
255 aa  237  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 
259 aa  237  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0096  triosephosphate isomerase  51.02 
 
 
255 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  48.66 
 
 
260 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.37173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  52 
 
 
250 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>