More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0301 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  83.12 
 
 		 231 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  72.93 
 
 		 233 aa  349  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.62 
 
 		 226 aa  348  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  67.11 
 
 		 235 aa  324  8.000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.69 
 
 		 231 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.69 
 
 		 231 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.65 
 
 		 231 aa  315  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  59.03 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  61.06 
 
 		 245 aa  271  9e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  60.62 
 
 		 245 aa  268  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  57.96 
 
 		 242 aa  267  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  57.96 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01871  two-component response regulator  56.9 
 
 		 242 aa  261  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.528311  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01981  two-component response regulator  55.02 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.125891  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01891  two-component response regulator  56.47 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0171  two component LuxR family transcriptional regulator  55.46 
 
 		 242 aa  258  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27181  two-component response regulator  57.89 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.98 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.65 
 
 		 229 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.92 
 
 		 221 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  40.53 
 
 		 225 aa  181  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 212 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 227 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.04 
 
 		 217 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115662  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11994  diatom response regulator 2  36.86 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4025  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.236685 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45539  diatom response regulator 1  35.83 
 
 		 319 aa  155  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2666  two component transcriptional regulator, AraC family  40.6 
 
 		 251 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21287  normal  0.224489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.68 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.91 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 124 aa  111  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  31.36 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  31.94 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  39.26 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  39.1 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 390 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.11 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0574949  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.32 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01421  two-component response regulator  37.06 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.11 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.3 
 
 		 313 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.11 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45 
 
 		 326 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1494  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02001  two-component response regulator  36.36 
 
 		 265 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.824437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.95 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  29.26 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  31.48 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01561  two-component response regulator  38.52 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22181  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.53 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.42 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.8 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  39.5 
 
 		 170 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.4 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.43 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.19 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  37.43 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  41.35 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  28.82 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>