More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0511 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_7028  acetyl-CoA synthetase  62.29 
 
 
585 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.277819 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3568  acetyl-CoA synthetase  64.29 
 
 
588 aa  749    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0207513  normal  0.0354675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2174  acetyl-CoA synthetase  59.72 
 
 
588 aa  701    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2708  acetyl-CoA synthetase  59.54 
 
 
576 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.180648  hitchhiker  0.00000972511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1608  acetyl-CoA synthetase  62.31 
 
 
584 aa  748    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.281409  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0927  acetyl-CoA synthetase  63.37 
 
 
588 aa  731    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4644  acetyl-CoA synthetase  64.29 
 
 
588 aa  749    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291537  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0388  acetyl-CoA synthetase  63.71 
 
 
602 aa  716    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0761  acetyl-CoA synthetase  65.08 
 
 
592 aa  748    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000550868  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1412  acetyl-CoA synthetase  64.91 
 
 
587 aa  739    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2597  acetyl-CoA synthetase  59.76 
 
 
588 aa  670    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0867997  hitchhiker  0.000215379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0511  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
607 aa  1221    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3465  AMP-dependent synthetase and ligase  64.88 
 
 
598 aa  749    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3600  acetyl-CoA synthetase  59.3 
 
 
584 aa  695    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1407  acetyl-CoA synthetase  62.86 
 
 
598 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  48.43 
 
 
571 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  47.47 
 
 
571 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4801  acetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4394  acetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4411  acetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4775  acetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0464  acetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000164986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4797  acetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
572 aa  525  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4560  acetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
572 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4915  acetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
572 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4780  acetyl-CoA synthetase  48.17 
 
 
572 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3335  acetyl-CoA synthetase  47.65 
 
 
572 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4493  acetyl-CoA synthetase  47.83 
 
 
572 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  45.22 
 
 
568 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  45.22 
 
 
568 aa  514  1e-144  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0180  AMP-dependent synthetase and ligase  48.58 
 
 
553 aa  505  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2650  AMP-dependent synthetase and ligase  47.45 
 
 
553 aa  462  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2340  AMP-dependent synthetase and ligase  44.08 
 
 
539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  43.97 
 
 
560 aa  399  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1854  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 
567 aa  392  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0491  acetate/CoA ligase  39.89 
 
 
635 aa  389  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0567  acetate--CoA ligase  38.27 
 
 
625 aa  382  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.749449  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  40.66 
 
 
670 aa  385  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1389  acetate--CoA ligase  40.14 
 
 
632 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  40.14 
 
 
632 aa  381  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  38 
 
 
650 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0915  acetate--CoA ligase  39.62 
 
 
631 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772613  hitchhiker  0.00000000159827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  41.4 
 
 
629 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  39.05 
 
 
639 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1721  acetate--CoA ligase  38.77 
 
 
629 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  39.86 
 
 
659 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  38.64 
 
 
653 aa  372  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0089  acetate/CoA ligase  38.03 
 
 
626 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.191746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0352  acetate--CoA ligase  37.95 
 
 
629 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330071  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  37.83 
 
 
650 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  38.77 
 
 
644 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  39.31 
 
 
661 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1300  AMP-dependent synthetase and ligase  41.01 
 
 
627 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  38.82 
 
 
652 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1587  acetate/CoA ligase  36.91 
 
 
632 aa  364  3e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.900608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  39.31 
 
 
667 aa  364  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  38.53 
 
 
639 aa  363  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1319  acetate/CoA ligase  39.05 
 
 
631 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  37.92 
 
 
632 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  37.74 
 
 
632 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  38.34 
 
 
655 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
552 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  38.1 
 
 
631 aa  360  6e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  37.74 
 
 
631 aa  359  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1137  acetyl-coenzyme A synthetase  36.12 
 
 
629 aa  359  9e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  36.05 
 
 
658 aa  359  9e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  36.05 
 
 
658 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  38.72 
 
 
660 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  38.72 
 
 
638 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3521  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 
636 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.728516  normal  0.613909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  37.8 
 
 
667 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  37.39 
 
 
666 aa  355  2e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  38.62 
 
 
657 aa  353  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  38 
 
 
656 aa  353  5e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  37.84 
 
 
667 aa  353  5e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  37.63 
 
 
657 aa  353  7e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  37.38 
 
 
661 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  38.18 
 
 
666 aa  352  1e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 
552 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1019  acetyl-coenzyme A synthetase  36.82 
 
 
652 aa  351  2e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  38.29 
 
 
655 aa  350  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  37.85 
 
 
667 aa  349  6e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_992  acetyl-CoA synthetase  36.82 
 
 
652 aa  349  9e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.091013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  37.09 
 
 
664 aa  348  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  38.34 
 
 
656 aa  348  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  38.24 
 
 
651 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  37.46 
 
 
666 aa  347  5e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  37.39 
 
 
657 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  37.39 
 
 
638 aa  346  6e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1209  acetyl-CoA synthetase  35.9 
 
 
652 aa  346  7e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  37.22 
 
 
667 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  38.78 
 
 
661 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  37.11 
 
 
656 aa  343  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  38.07 
 
 
648 aa  343  5e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  35.64 
 
 
650 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  38.25 
 
 
668 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  35.57 
 
 
652 aa  340  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  37.61 
 
 
658 aa  340  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1478  acetate/CoA ligase  37.07 
 
 
657 aa  339  9e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  37.2 
 
 
645 aa  339  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>