More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0020 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  100 
 
 		 150 aa  306  8e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  75.33 
 
 		 140 aa  228  3e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  62.91 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  65.56 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  61.78 
 
 		 150 aa  184  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  61.84 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 165 aa  153  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  40.25 
 
 		 157 aa  118  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  41.77 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  36.84 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  40.28 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  50.5 
 
 		 148 aa  99.8  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  36.88 
 
 		 187 aa  94  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 168 aa  92.8  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  34.44 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  40 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 		 209 aa  92.8  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  39.19 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  34.3 
 
 		 188 aa  92  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20510  single-stranded DNA-binding protein  38.83 
 
 		 106 aa  92  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.85745  normal  0.160055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  40 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  44.07 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  44.74 
 
 		 175 aa  90.9  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  39.86 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  34.44 
 
 		 151 aa  90.5  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 175 aa  90.5  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  34.97 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  48.57 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  36.59 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  40.83 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  37.01 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  39.47 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  36.24 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  38.76 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  32.7 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  33.77 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  38.79 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  34.27 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  33.57 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  33.72 
 
 		 171 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 183 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  42 
 
 		 156 aa  84.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 163 aa  84.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  44 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  36.24 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  32.08 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  30.68 
 
 		 188 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  35.33 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  40.94 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 193 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  42 
 
 		 173 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  42 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  40.68 
 
 		 154 aa  83.6  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  39.34 
 
 		 222 aa  83.6  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  35.22 
 
 		 161 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 186 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  35.85 
 
 		 182 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  41 
 
 		 167 aa  83.6  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  32.4 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  32.4 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  32.4 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  32.4 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  32.4 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  32.4 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  32.4 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  35.1 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  32.4 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  41 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  38.51 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  37.7 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>