More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4911 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  46.23 
 
 		 4646 aa  702    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  43.53 
 
 		 3130 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  45.73 
 
 		 1466 aa  684    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  43.71 
 
 		 1424 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  40.95 
 
 		 1795 aa  723    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  42.65 
 
 		 1646 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  41.2 
 
 		 2710 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  46.49 
 
 		 1574 aa  757    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  43.61 
 
 		 1302 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  43.89 
 
 		 3108 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 		 995 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  46.32 
 
 		 2498 aa  698    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  44.24 
 
 		 3090 aa  687    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  43.68 
 
 		 3093 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  45.63 
 
 		 1520 aa  687    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  37.14 
 
 		 1497 aa  663    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  41.88 
 
 		 2150 aa  664    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  40.85 
 
 		 995 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  43.11 
 
 		 1489 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  41.18 
 
 		 1909 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  40.92 
 
 		 1408 aa  678    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  42.1 
 
 		 1653 aa  740    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  41.99 
 
 		 2093 aa  658    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  45.15 
 
 		 1911 aa  732    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  42.34 
 
 		 1470 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 1466 aa  2848    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  44.94 
 
 		 1582 aa  729    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  45.95 
 
 		 1535 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  45.16 
 
 		 1560 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  44.6 
 
 		 3089 aa  690    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  45.23 
 
 		 2684 aa  686    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  41.54 
 
 		 4647 aa  635  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  41.6 
 
 		 1488 aa  635  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  33.75 
 
 		 1416 aa  635  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  44.94 
 
 		 2604 aa  632  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  42.48 
 
 		 1472 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  42.37 
 
 		 1472 aa  629  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  34.36 
 
 		 1465 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  42.37 
 
 		 1472 aa  629  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  39.35 
 
 		 1833 aa  625  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  41.3 
 
 		 2679 aa  624  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  43.85 
 
 		 974 aa  615  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  38.71 
 
 		 2176 aa  610  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  39.85 
 
 		 2273 aa  601  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  41.14 
 
 		 1486 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  36.4 
 
 		 2316 aa  586  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  40.51 
 
 		 4186 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  40.87 
 
 		 3335 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  42.74 
 
 		 2454 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  39 
 
 		 3194 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  35.7 
 
 		 1612 aa  576  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  35.7 
 
 		 1612 aa  576  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  42.66 
 
 		 1000 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  40.52 
 
 		 1524 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  38.55 
 
 		 2682 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  42.7 
 
 		 4265 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  35.33 
 
 		 2243 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  42.58 
 
 		 4265 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.58 
 
 		 4239 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  36.72 
 
 		 2462 aa  539  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  34.96 
 
 		 2226 aa  539  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  35.19 
 
 		 1087 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  39.65 
 
 		 1528 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  40 
 
 		 1530 aa  528  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  38.07 
 
 		 3163 aa  525  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.91 
 
 		 3133 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  39.89 
 
 		 1530 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  42.91 
 
 		 3127 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  39.25 
 
 		 3173 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  35.72 
 
 		 2762 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.45 
 
 		 6889 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 		 2551 aa  512  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.04 
 
 		 1656 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  34.64 
 
 		 2551 aa  510  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  39.15 
 
 		 4478 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  35.58 
 
 		 1587 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  34.2 
 
 		 1354 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  37.96 
 
 		 3275 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.06 
 
 		 1337 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 1874 aa  492  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.12 
 
 		 3696 aa  486  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  49.8 
 
 		 3235 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.22 
 
 		 1559 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.6 
 
 		 3424 aa  479  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  37.54 
 
 		 3337 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.22 
 
 		 3676 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.01 
 
 		 1559 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  34.66 
 
 		 2880 aa  476  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  45.77 
 
 		 926 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.13 
 
 		 3693 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.13 
 
 		 3693 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  39.19 
 
 		 2477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.25 
 
 		 3702 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  37.64 
 
 		 2047 aa  465  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.62 
 
 		 3679 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  39.93 
 
 		 4080 aa  466  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  32.53 
 
 		 3099 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  37.61 
 
 		 1402 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.51 
 
 		 7279 aa  459  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11682  polyketide synthase pks9  37.78 
 
 		 1017 aa  458  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.910189  normal  0.256718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>