260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0531 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  99.02 
 
 
306 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  67.96 
 
 
303 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  68.18 
 
 
310 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  61.6 
 
 
318 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  50.15 
 
 
340 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  53.33 
 
 
314 aa  291  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  57.69 
 
 
320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  48.08 
 
 
319 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  50.19 
 
 
321 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  51.81 
 
 
308 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  46.22 
 
 
300 aa  215  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  45.8 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  47.06 
 
 
292 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  45.38 
 
 
285 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  45.8 
 
 
295 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  46.22 
 
 
301 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  45.38 
 
 
292 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  44.96 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  44.96 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  44.96 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  44.8 
 
 
285 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  44.8 
 
 
303 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  44.96 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  44.96 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  44.96 
 
 
292 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  46.22 
 
 
316 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  46.22 
 
 
295 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  46.22 
 
 
295 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  46.22 
 
 
295 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  44.96 
 
 
292 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  45.38 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  44.96 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  44.35 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  41.63 
 
 
218 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  40.87 
 
 
236 aa  148  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  35.83 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  35.74 
 
 
240 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  33.74 
 
 
261 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  29.61 
 
 
243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  30.34 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  28.39 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  30.13 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  33.18 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  29 
 
 
244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  27.63 
 
 
238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  26.14 
 
 
251 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  28.03 
 
 
252 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  31.51 
 
 
241 aa  106  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  28.05 
 
 
237 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  27.66 
 
 
239 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  25.43 
 
 
234 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  29 
 
 
244 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  32.49 
 
 
246 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  32.49 
 
 
246 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  33.19 
 
 
242 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  22.65 
 
 
237 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  35.78 
 
 
217 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  34.82 
 
 
265 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  32.61 
 
 
245 aa  96.3  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  26.72 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  34.93 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2274  protein of unknown function DUF45  31.3 
 
 
243 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  31.33 
 
 
237 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  27.53 
 
 
240 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  31.51 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1084  protein of unknown function DUF45  33.68 
 
 
221 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  25.35 
 
 
224 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  29.41 
 
 
241 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  28.96 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  25.11 
 
 
226 aa  90.5  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  28.36 
 
 
243 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  35.03 
 
 
244 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  34.44 
 
 
228 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  27.7 
 
 
224 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  21.16 
 
 
238 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  29.13 
 
 
240 aa  89  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  36.27 
 
 
228 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  30.13 
 
 
251 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  26.67 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0303  hypothetical protein  31.17 
 
 
266 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  29.86 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0010  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  33.33 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  26.53 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  24.47 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  29.08 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.44 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  26.89 
 
 
262 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  22.13 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  32.91 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2552  hypothetical protein  21.52 
 
 
217 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000141461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  30.09 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  25.56 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0094  hypothetical protein  38.76 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  23.32 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  34.25 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  25.51 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  27.87 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  41.3 
 
 
256 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>