More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0846 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 325 aa  634    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  51.84 
 
 		 327 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  53.7 
 
 		 291 aa  258  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  49.83 
 
 		 368 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  53.79 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  53.58 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  60.98 
 
 		 199 aa  133  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  44 
 
 		 202 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  56.76 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  54.79 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  52.76 
 
 		 216 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  48.82 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  58.68 
 
 		 217 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  60.75 
 
 		 206 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  53.15 
 
 		 211 aa  119  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  51.08 
 
 		 207 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  55.26 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  50.34 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  58.88 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  46.72 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  48.23 
 
 		 196 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  48.76 
 
 		 189 aa  115  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  46.72 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  45.9 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  45.9 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2744  lytic transglycosylase, catalytic  54.46 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1919  Lytic transglycosylase catalytic  38.07 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  45.9 
 
 		 261 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  50 
 
 		 174 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  52.14 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  49.58 
 
 		 191 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  51.4 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  48.97 
 
 		 195 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  54.31 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3973  lytic transglycosylase catalytic  58.25 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3638  lytic transglycosylase catalytic  57.28 
 
 		 206 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.237 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  45.08 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  45.08 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  45.08 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  45.08 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  47.9 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1781  Slt family transglycosylase  45.08 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0369322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  49.11 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  45.14 
 
 		 215 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  50 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1376  lytic transglycosylase catalytic  47.06 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000477614  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1036  Lytic transglycosylase catalytic  53.15 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.962851 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0512  Lytic transglycosylase catalytic  55.05 
 
 		 154 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.318275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  50.89 
 
 		 146 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1800  lytic transglycosylase, catalytic  50.42 
 
 		 242 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.272775  normal  0.55672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  40.43 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  46.34 
 
 		 204 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  42.5 
 
 		 273 aa  106  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  46.34 
 
 		 204 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  51.72 
 
 		 247 aa  106  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0527  Lytic transglycosylase catalytic  55.05 
 
 		 155 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.193488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  50.83 
 
 		 212 aa  105  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3822  lytic transglycosylase, catalytic  51.3 
 
 		 204 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.539253  normal  0.0346403 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  48.82 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  48.39 
 
 		 215 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  50.45 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  53.66 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  49.57 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  46.22 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00442  soluble lytic murein transglycosylase  49.57 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129314  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  51.94 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  43.07 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  47.5 
 
 		 189 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  44.1 
 
 		 208 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1871  lytic transglycosylase, catalytic  45.83 
 
 		 281 aa  103  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000100876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1380  Lytic transglycosylase catalytic  49.58 
 
 		 234 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033505 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  51.38 
 
 		 158 aa  102  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  45.32 
 
 		 206 aa  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3860  lytic transglycosylase, catalytic  54.13 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  50.38 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  52.63 
 
 		 204 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0443  lytic transglycosylase, catalytic  56.36 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.270121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  39.26 
 
 		 224 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  45.45 
 
 		 245 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 245 aa  99.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  50.46 
 
 		 226 aa  99.8  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  57.28 
 
 		 271 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 		 283 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 		 237 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  49.14 
 
 		 249 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1360  Lytic transglycosylase catalytic  47.86 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  52.17 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  49.51 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0406  Lytic transglycosylase catalytic  54.72 
 
 		 258 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.717558  normal  0.0556667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  54.37 
 
 		 188 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  41.9 
 
 		 224 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  36.81 
 
 		 234 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9819  type IV system transglycosylase  49.51 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 200 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 223 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  42.86 
 
 		 223 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 223 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2464  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 442 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>