More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4524 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
450 aa  876    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  73.43 
 
 
433 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  70.4 
 
 
407 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  70.65 
 
 
407 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  62.53 
 
 
420 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  62.53 
 
 
420 aa  428  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  50.94 
 
 
436 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  56.15 
 
 
395 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4386  major facilitator transporter  56.19 
 
 
409 aa  338  8e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95223  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.87 
 
 
418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  32.18 
 
 
412 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  30.48 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  29.63 
 
 
407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  32.41 
 
 
390 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  28.54 
 
 
425 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  32.13 
 
 
390 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  31.18 
 
 
390 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  28.99 
 
 
413 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.9 
 
 
418 aa  107  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  28.1 
 
 
405 aa  106  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
395 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
392 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
413 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  29.94 
 
 
416 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  26.41 
 
 
432 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  26.68 
 
 
427 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  27.08 
 
 
420 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  30.68 
 
 
412 aa  100  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
415 aa  99.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  29.03 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  23.64 
 
 
445 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  30.98 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.72 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  24.74 
 
 
417 aa  96.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  24.4 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  30.16 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  25 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  30.16 
 
 
397 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  31.82 
 
 
410 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  30.16 
 
 
430 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  29.7 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  29.7 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  29.7 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  29.7 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  29.7 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  28.77 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  30.75 
 
 
410 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
441 aa  94.4  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  25 
 
 
430 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  27.58 
 
 
493 aa  94  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  30.16 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  26.03 
 
 
420 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  26.42 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  26.8 
 
 
427 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28.35 
 
 
428 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  31.18 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  28.33 
 
 
461 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  31.02 
 
 
405 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  31.43 
 
 
405 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  31.43 
 
 
405 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.36 
 
 
417 aa  86.3  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  24.59 
 
 
415 aa  86.3  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  23.48 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
437 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  31.02 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.35 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.3 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  26.95 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  24.78 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  26.01 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  24.93 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  25.07 
 
 
416 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.15 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  27.48 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  20.95 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.06 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  26 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  23.8 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  26.82 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  26.28 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  28.22 
 
 
452 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  26.42 
 
 
432 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  28.22 
 
 
452 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  21.1 
 
 
443 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
371 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  28.33 
 
 
384 aa  63.2  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  21.72 
 
 
430 aa  63.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  23.32 
 
 
432 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  27.92 
 
 
439 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  23.66 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  24.75 
 
 
917 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>