More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0052 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0052  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
149 aa  315  1e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  66.67 
 
 
150 aa  217  4e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  1.46493e-06  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  64.63 
 
 
147 aa  214  3e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4741  ribosomal protein L13  65.31 
 
 
147 aa  211  2e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  8.31745e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0721  ribosomal protein L13  63.27 
 
 
151 aa  204  4e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3039  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
147 aa  197  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0862388  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04085  50S ribosomal protein L13  60.54 
 
 
151 aa  196  1e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0375  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
151 aa  195  2e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.958432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1612  50S ribosomal protein L13  59.18 
 
 
151 aa  193  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0318086  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  53.79 
 
 
147 aa  186  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  56.46 
 
 
147 aa  180  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 
149 aa  172  1e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
150 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
150 aa  167  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 
170 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0243  50S ribosomal protein L13  51.01 
 
 
159 aa  167  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0225  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 
151 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0222  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 
151 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0145687  normal  0.0118859 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  52.41 
 
 
149 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 
142 aa  166  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 
142 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 
142 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  165  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 
145 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 
151 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  52.05 
 
 
149 aa  164  3e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 
145 aa  164  3e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.14694e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
145 aa  164  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.05629e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
142 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  52.41 
 
 
151 aa  164  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
142 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 
142 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
150 aa  163  7e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  53.1 
 
 
150 aa  162  1e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 
142 aa  162  1e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  55.88 
 
 
143 aa  162  1e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 
142 aa  162  2e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2937  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
187 aa  162  2e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  53.9 
 
 
142 aa  162  2e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  51.72 
 
 
149 aa  162  2e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 
142 aa  161  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  54.41 
 
 
143 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 
142 aa  161  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 
143 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 
142 aa  160  5e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 
142 aa  160  5e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 
142 aa  160  5e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.18525e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  53.42 
 
 
149 aa  160  5e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  51.05 
 
 
148 aa  160  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  9.65518e-09  hitchhiker  9.92925e-11 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  55.15 
 
 
143 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
142 aa  160  8e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  160  8e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 
150 aa  160  8e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1395  ribosomal protein L13  51.77 
 
 
146 aa  159  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  1.19663e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  51.43 
 
 
145 aa  159  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  9.86136e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
142 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf386  50S ribosomal protein L13  51.41 
 
 
144 aa  158  2e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.112252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
145 aa  158  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.03793e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
145 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  1.63354e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
145 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.80183e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  52.52 
 
 
163 aa  159  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
145 aa  158  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
145 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
145 aa  158  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.75046e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 
144 aa  158  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.46357e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
145 aa  158  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.45264e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
142 aa  157  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  51.88 
 
 
150 aa  157  3e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
151 aa  157  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  50.35 
 
 
144 aa  157  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.57006e-06  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 
142 aa  157  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  8.43127e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 
142 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  4.35691e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 
145 aa  156  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  7.49627e-09  hitchhiker  1.137e-08 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  55.32 
 
 
146 aa  155  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
142 aa  156  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  156  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.31451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  51.77 
 
 
142 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  1.37696e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 
144 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.32589e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  52.48 
 
 
144 aa  155  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  49.29 
 
 
145 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  7.51399e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  49.64 
 
 
145 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  6.68177e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0252  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 
142 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  6.74786e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  51.06 
 
 
145 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-05  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1941  50S ribosomal protein L13  52.14 
 
 
142 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.62792e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1319  ribosomal protein L13  53.9 
 
 
149 aa  154  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.80495e-06  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.05135e-07  hitchhiker  3.559e-05 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  50.71 
 
 
142 aa  154  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.5141e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  50.7 
 
 
151 aa  154  5e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 
144 aa  154  5e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.19018e-10  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
144 aa  153  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  49.65 
 
 
142 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.11952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
144 aa  153  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  50.37 
 
 
148 aa  153  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 
147 aa  153  9e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1178  50S ribosomal protein L13  49.3 
 
 
153 aa  153  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130484  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.18641e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  48.94 
 
 
142 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  50 
 
 
143 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.77368e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>