More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0547 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
410 aa  799  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  94.9 
 
 
412 aa  717  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  94.16 
 
 
411 aa  686  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  74.73 
 
 
381 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  60 
 
 
405 aa  417  1e-115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  58.31 
 
 
392 aa  417  1e-115  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  57.78 
 
 
405 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  58.74 
 
 
425 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  60.8 
 
 
431 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  60.33 
 
 
412 aa  406  1e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  60.33 
 
 
412 aa  406  1e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  61.86 
 
 
412 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.35 
 
 
422 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.82 
 
 
433 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  59.84 
 
 
424 aa  398  1e-110  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  61.54 
 
 
418 aa  399  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  59.84 
 
 
424 aa  398  1e-110  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  59.95 
 
 
424 aa  401  1e-110  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  59.62 
 
 
420 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  59.34 
 
 
420 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  59.34 
 
 
420 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  59.07 
 
 
420 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  59.34 
 
 
420 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.08 
 
 
399 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.52 
 
 
395 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  59.34 
 
 
420 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  59.34 
 
 
420 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  61.36 
 
 
432 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  58.47 
 
 
400 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  59.34 
 
 
420 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  61.36 
 
 
432 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  54.57 
 
 
386 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.17 
 
 
410 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  59.3 
 
 
394 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.52 
 
 
386 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0478  RND family efflux transporter MFP subunit  61.96 
 
 
416 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  normal  0.0228976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  55.35 
 
 
383 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  55.09 
 
 
442 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  58.12 
 
 
398 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  59.73 
 
 
423 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0708  membrane fusion protein, RND efflux pump  58.84 
 
 
410 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  54.34 
 
 
395 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  54.34 
 
 
388 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  54.34 
 
 
395 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  54.1 
 
 
395 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  2.30672e-08 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  53.89 
 
 
397 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  55.62 
 
 
394 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  55.41 
 
 
387 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.06 
 
 
396 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.92 
 
 
393 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.35 
 
 
469 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  52.86 
 
 
384 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  56.25 
 
 
400 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.09 
 
 
423 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  54.07 
 
 
409 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  59.06 
 
 
409 aa  363  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  53.22 
 
 
384 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.86 
 
 
384 aa  362  5e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  53.02 
 
 
381 aa  362  5e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  50.64 
 
 
418 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  50.64 
 
 
418 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  56.94 
 
 
395 aa  362  8e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  53.81 
 
 
409 aa  362  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.81 
 
 
397 aa  361  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  53.81 
 
 
397 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  53.81 
 
 
397 aa  361  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  53.81 
 
 
397 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  53.81 
 
 
397 aa  361  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  53.81 
 
 
397 aa  361  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  55.19 
 
 
386 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  52.73 
 
 
418 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  53.54 
 
 
409 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  52.59 
 
 
384 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  50.96 
 
 
383 aa  360  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.65031e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.74 
 
 
397 aa  360  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  49.34 
 
 
386 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  6.22308e-11  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  53.1 
 
 
382 aa  359  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  52.29 
 
 
385 aa  358  1e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  52.02 
 
 
385 aa  357  2e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  53.56 
 
 
415 aa  357  2e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.64 
 
 
398 aa  357  2e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  52.47 
 
 
381 aa  357  3e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.47 
 
 
381 aa  357  3e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  52.02 
 
 
385 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.10651e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  52.02 
 
 
385 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  52.02 
 
 
385 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.02 
 
 
385 aa  356  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  49.87 
 
 
379 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  51.75 
 
 
385 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  51.75 
 
 
385 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  53.66 
 
 
385 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  51.75 
 
 
385 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  56.43 
 
 
415 aa  352  6e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  53.91 
 
 
385 aa  352  9e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  53.91 
 
 
385 aa  352  9e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  53.91 
 
 
385 aa  352  9e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  53.01 
 
 
390 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  57.14 
 
 
397 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  57.14 
 
 
397 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  51.67 
 
 
383 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>