96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2367 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl2367  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  473  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2514  hypothetical protein  97.35 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2196  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.39 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1324  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.73 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.557564  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5471  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.96 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0406777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4812  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.96 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3555  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.96 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0891  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.43 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138427  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1425  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.16 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1391  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.16 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0214  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.46 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0532719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0787  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.78 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000209918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0432  D-alanyl-D-alanine dipeptidase-like  32.17 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34989  normal  0.285253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0533  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  32.72 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.116502  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4490  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  31.02 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0087  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.57 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2448  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.09 
 
 		 251 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0161  D-ala-D-ala dipeptidase  30.34 
 
 		 251 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.834383  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07931  D-ala-D-ala dipeptidase  30.77 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1243  D-ala-D-ala dipeptidase  30.7 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10061  D-ala-D-ala dipeptidase  29.39 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.331576  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0765  D-ala-D-ala dipeptidase  33.48 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.667505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4557  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.91 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08171  D-ala-D-ala dipeptidase  33.77 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1551  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.27 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2224  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.31 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0622  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.99 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16701  D-ala-D-ala dipeptidase  31 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.846415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0462  d-alanyl-d-alanine dipeptidase, putative  28.99 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.528345  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1226  putative D-alanyl-D-alanine dipeptidase  27.75 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.101046  normal  0.395432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39780  D-ala-D-ala dipeptidase  28.25 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3149  putative D-alanyl-d-alanine dipeptidase  29.49 
 
 		 270 aa  81.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00328956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15160  hypothetical protein  29.78 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803712  hitchhiker  0.0000117372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1333  peptidase M15D, VanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.71 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0663  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.33 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0344  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.22 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2119  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.03 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1206  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  44 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22940  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  29.17 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3762  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  41.33 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.553521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1343  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  30.82 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1685  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.62 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1654  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.61 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.52906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4003  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  36.99 
 
 		 188 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4601  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  22.52 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2133  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  22.58 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1751  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.62 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1441  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.88 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.494405  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6300  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.62 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1677  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.25 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1627  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  36.49 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0763  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.33 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.0376933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2100  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.25 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4116  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  36 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53772  normal  0.253468 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11948  probable peptidase  37.33 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2169  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  34.25 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.159114  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2159  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.25 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01458  hypothetical protein  34.25 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01446  D-ala-D-ala dipeptidase, Zn-dependent  34.25 
 
 		 193 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3026  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138377  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1393  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.14 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0694639  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0246  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.14 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620144  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0517  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.14 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1312  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.14 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1051  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.14 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2563  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.14 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1273  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.14 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.327296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04244  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  33.33 
 
 		 248 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0522  D-Ala-D-Ala dipeptidase  28.76 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1661  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  26.35 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1785  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  31.51 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113929 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4478  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.77 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129576  normal  0.531812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2248  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  33.68 
 
 		 259 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.392208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1573  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.88 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0198  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  32.88 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3562  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  35.14 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.271159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4059  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  30.14 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0800  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.84 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0574053  normal  0.256235 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4016  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.77 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1358  hypothetical protein  51.28 
 
 		 43 aa  45.8  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2426  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  29.2 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0429393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0077  D-Ala-D-Ala dipeptidase  30 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.033757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4285  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.33 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2346  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  31.58 
 
 		 187 aa  45.1  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4590  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.77 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.977073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3778  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.77 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1902  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  34.25 
 
 		 404 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0509  peptidase M15D, vanX D-ala-D-ala dipeptidase  24.22 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5715  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.77 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0449743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0840  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  37.84 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.593673 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1254  D-alanyl-D-alanine dipeptidase  28.77 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5357  D-Ala-D-Ala dipeptidase  35.9 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.395884  normal  0.146315 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0835  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  35.62 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0247724 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25870  D-Ala-D-Ala dipeptidase vanX  34.62 
 
 		 254 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0653  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  28.75 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5792  peptidase M15D vanX D-ala-D-ala dipeptidase  32.05 
 
 		 202 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>